Microbiologia
Codi: 100852 Crèdits: 6| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| 2500251 Biologia ambiental | FB | 2 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Nuria Gaju Ricart
- Correu electrònic:
- nuria.gaju@uab.cat
Equip docent
- Olga Sanchez Martinez
- Nuria Vigues Frantzen
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Tot i que no hi ha cap prerequisit oficial, s’aconsella als estudiants revisar els conceptes que es refereixen al món microbià, estudiats prèviament.
Objectius
Es tracta d’una assignatura obligatòria, nuclear del grau de Biologia Ambiental, que introdueix als estudiants en el món microbià, donant una visió general dels microorganismes, en connexió amb la resta d’éssers vius i amb els diferents ambients en els quals aquells viuen.
Aquesta assignatura, atès el seu caire introductori, dóna els conceptes i les competències més bàsiques referides a la Microbiologia, per tal que els estudiants puguin aprofundir en els següents cursos en altres assignatures més especialitzades de Microbiologia.
Objectius de l’assignatura:
1. Reconèixer a grans trets la diversitat microbiana i saber distingir les característiques que defineixen els diferents grups microbians.
2. Identificar les diferents estructures, així com la composició de la cèl·lula procariota.
3. Conèixer la versatilitat metabòlica dels diferents grups microbians, particularment la dels procariotes.
4. Conèixer la variabilitat genòmica dels microorganismes i els principals mecanismes d’intercanvi d’informació genètica en procariotes.
5. Reconèixer les principals relacions dels microorganismes amb els éssers vius i amb l’entorn físic que habiten.
6. Conèixer el paper dels microorganismes en el desenvolupament de les societats humanes, així com les seves futures aplicacions.
7. Saber realitzar càlculs bàsics per determinar paràmetres microbiològics.
8. Comprendre i saber aplicar tècniques bàsiques de laboratori per treballar experimentalment amb microorganismes.
Competències
- Actuar en l'àmbit de coneixement propi valorant l'impacte social, econòmic i mediambiental.
- Aplicar recursos d'informàtica relatius a l'àmbit d'estudi.
- Comunicar-se eficaçment oralment i per escrit.
- Gestionar, conservar i restaurar poblacions i ecosistemes.
- Identificar i interpretar la diversitat d'espècies en el medi.
- Introduir canvis en els mètodes i els processos de l'àmbit de coneixement per donar respostes innovadores a les necessitats i demandes de la societat.
- Mostrejar, caracteritzar i manipular poblacions i comunitats.
- Obtenir, observar, manejar, conrear i conservar espècimens.
- Resoldre problemes.
Resultats d'aprenentatge
- Actuar en l'àmbit de coneixement propi valorant l'impacte social, econòmic i mediambiental.
- Aplicar recursos d'informàtica relatius a l'àmbit d'estudi.
- Comunicar-se eficaçment oralment i per escrit.
- Identificar el paper dels microorganismes en el medi.
- Introduir canvis en els mètodes i els processos de l'àmbit de coneixement per donar respostes innovadores a les necessitats i demandes de la societat.
- Reconèixer el paper dels microorganismes en malalties i en processos industrials.
- Reconèixer els diferents grups microbians.
- Resoldre problemes.
- Utilitzar equips bàsics de laboratori i aplicar les tècniques que permeten treballar amb microorganismes.
Continguts
CONTINGUT TEÒRIC (3,6 ECTS)
Tema 1. El món dels microorganismes
La història i les societats humanes i els microorganismes. Descobrint els microorganismes. Nivells d'organització. Principals diferències entre virus i organismes cel•lulars. Organització procariòtica i eucariòtica. Grups i denominació dels microorganismes.
Tema 2. Morfologia, estructura i composició química dels virus
Concepte de virus. Morfologia de les partícules víriques: simetries icosaèdrica, helicoïdal i complexa. Estructura de l’envolta vírica. El genoma víric. Enzims.
Tema 3. Relacions virus-cèl.lula hoste
Cicle víric: el creixement en graó. Adsorció i penetració. Replicació del genoma. Muntatge i alliberament dels virions. Possibles efectes de la multiplicació vírica sobre l’hoste.
Tema 4. Classificació i diversitat dels virus
Criteris de classificació dels virus (ICVT). Nomenclatura. Classificació de Baltimore. Virus de procariotes i d’eucariotes. Altres agents infecciosos subcel.lulars.
Tema 5. Estructura i funció de la cèl·lula procariòtica
Grandària i morfologia. Membrana citoplasmàtica. Estructura i funció de la paret cel·lular. Càpsules i capes mucoses. El citoplasma. La regió nuclear. Inclusions funcionals i de reserva. Apèndix. Principals mecanismes de motilitat. Tactismes microbians. Endòspores.
Tema 6. El genoma dels procariotes
Estructura del genoma. Mida, topologia i número de cromosomes. Material genètic extracromosòmic: plasmidis. Elements transponibles. Genòmica microbiana.
Tema 7. Mutagènesi
Tipus de mutacions. Efectes. Causes. Reparació del DNA. Selecció de mutants.
Tema 8. Mecanismes de transferència genètica
Recombinació. Transformació, transducció i conjugació.
Tema 9. El cicle cel·lular dels procariotes
Divisió binària. Divisió cel·lular i control. Diversitat del cicle cel·lular dels procariotes.
Tema 10. Creixement microbià. Influència dels factors ambientals sobre el creixement
Creixement exponencial. Cicle de creixement en poblacions. Factors ambientals que afecten el creixement: temperatura, pH, disponibilitat d’aigua, oxigen i pressió.
Tema 11. Control del creixement microbià
Mètodes químics: esterilització per calor, radiació i filtració. Agents antimicrobians. Mesura de l’activitat antimicrobiana. Resistència als antimicrobians.
Tema 12. Metabolisme: esquema global
Fonts d’energia, de carboni i de poder reductor. Classes metabòliques. Processos d’obtenció d’energia. Estratègia biosintètica.
Tema 13. Diversitat metabòlica I
Fototròfia, autotròfia, quimiolitotròfia i fixació de nitrogen.
Tema 14. Diversitat metabòlica II
Fermentacions. Respiració aneròbica.. Quimioorganotròfia aeròbica.
Tema 15. Diversitat de procariotes
L’origen de la vida i la diversificació biològica. Sistemàtica microbiana: taxonomia i filogènia. Rangs taxonòmics. Concepte d’espècie en procariotes. Tècniques per a determinar la taxonomia i la filogènia.
Tema 16. Els arqueus
Característiques diferencials: Euryarchaeota i Crenarchaeota. Phylum Euryarchaeota: Metanògens, Halòfils extrems. Thermoplasmatals, Thermococals i Methanopyrus, Archaeoglobals i Nanoarchaeum. Phylum Crenarchaeota: hipertermòfils i altres. Nous phyla d’arqueus.
Tema 17. Els bacteris Gram negatius proteobacteris
Subdivisions dins dels proteobacteris. Proteobacteris fotosintétics, quimiolitòtrofs i metanòtrofs. Proteobacteris quimioorganòtrofs aerobis o facultatius. Proteobacteris amb morfologies inusuals: espirals, prosteques, peduncles, gemes i beines. Delta i Épsilon proteobacteris.
Tema 18. Els bacteris Gram negatius no proteobacteris
Els cianobacteris. Els bacteris verds: Chlorobi i Chloroflexus. Les clamídies. Planctomyces. Les espiroquetes. Deinococcus i Thermus. Bacteris hipertermòfils. Altres phyla Gram negatius.
Tema 19. Els bacteris Gram positius i els micoplasmes
Bacteris Gram positius no formadors d’endòspores. Bacteris Gram positius formadors d’endòspores. Els micoplasmes. Actinobacteria: bacteris Gram positius amb alt contingut G+C.
Tema 20. Els microorganismes en el seu ambient
Concepte de microambient. Colonització de superfícies. Ambients aeri, terrestre i aquàtic, característiques principals. Relacions tròfiques en microorganismes.
Tema 21. Cicles biogeoquímics
Els microorganismes com a agents de canvi geoquímic. Cicle del carboni. Cicle del nitrogen.
CONTINGUT PROBLEMES I TÈCNIQUES (1 ECTS)
Mòdul 1. Tècnica microscòpica.
Mòdul 2. Tècnica de sembra i d’aïllament.
Mòdul 3. Observacions microscòpiques.
Mòdul 4. Problemes sobre Microbiologia bàsica.
Mòdul 5. Problemes sobre creixement i control microbià.
CONTINGUT PRÀCTIQUES DE LABORATORI (1,4 ECTS)
Mòdul 1. Recompte de microorganismes.
Mòdul 2. Aïllament de microorganismes
Mòdul 3. Observació de microorganismes.
Mòdul 4. Identificació de microorganismes.
Mòdul 5. Ubiqüitat i diversitat microbiana.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Classes de problemes | 8 | 0,32 | 3, 7, 8 |
| Classes practiques de laboratori | 12 | 0,48 | 4, 5, 7, 8 |
| Classes teoriques | 30 | 1,2 | 1, 2, 4, 6, 7 |
| Tipus: Supervisades | |||
| Tutories en grup i individuals | 4 | 0,16 | 3, 4, 6, 7, 8 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Estudi | 50 | 2 | 4, 6, 7 |
| Lectura de textos | 20 | 0,8 | 2 |
| Resolució de problemes | 20 | 0,8 | 8 |
METODOLOGIA DOCENT I ACTIVITATS FORMATIVES
L’assignatura de Microbiologia consta de tres mòduls d'activitats supervisades, els quals s’han programat de forma integrada de manera que l’estudiant haurà de relacionar al llarg de tot el curs el contingut i les activitats programades per tal d’assolir les competències indicades en aquesta guia.
Els tres mòduls són els següents:
Classes teòriques participatives: L’estudiant ha d’adquirir els coneixements científico-tècnics propis d’aquesta assignatura assistint a aquestes classes i complementant-les amb l’estudi personal dels temes explicats. A l'inici del curs es lliurarà a l’estudiant un calendari dels temes que es tractaran al llarg del curs, així com de la bibliografia que haurà de consultar per preparar cada classe teòrica i per a l’estudi personal dels continguts teòrics de l’assignatura. La impartició de cada tema es basarà en una exposició teòrica.
Classes sobre metodologia i problemes: Aquestes classes són sessions amb un nombre reduït d’alumnes amb la missió de: a) treballar aspectes metodològics, b) facilitar la comprensió dels coneixements exposats en les classes teòriques i c) fer de pont entre les classes teòriques i el treball pràctic de laboratori, amb l’objectiu d’integrar els coneixements teòrics amb els pràctics. A l'inici del curs l’estudiant rebrà un calendari del contingut de cada sessió, on s’indicarà la bibliografia que haurà de consultar i la relació de cada sessió amb els temes tractats en les classes teòriques i en les pràctiques de laboratori. També es lliurarà un dossier amb una proposta de problemes que haurà d’anar desenvolupant durant el curs. Les sessions es realitzaran a l’aula, on es tractarà sobre aspectes metodològics i sobre resolució de problemes bàsics de Microbiologia. Cada estudiant exposarà els passos que ha seguit per a la resolució dels problemes.
Classes pràctiques de laboratori: Previ a l'inici de les pràctiques l’alumne rebrà un Manual amb el treball pràctic que haurà de desenvolupar durant el curs. Els objectius d’aquestes activitats són: a) facilitar la comprensió dels coneixements exposats en les classes teòriques, b) practicar els dissenys experimentals desenvolupats en les sessions de problemes, c) adquirir destresa manual, d) interpretar resultats i e) integrar els coneixements teòrics amb els pràctics. L’assistència a les classes pràctiques és obligatòria per tal de poder adquirir les competències de l’assignatura. Per poder assistir-hi cal que l’estudiant justifiqui haver superat les proves de bioseguretat i seguretat que trobarà en l'aula Moodle i ser coneixedor i acceptar les normes de funcionament dels laboratoris de la Facultat de Biociències. A més, haurà de complir la normativa de treball en un laboratori de Microbiologia que trobarà indicada en el Manual. Per aconseguir un bon rendiment i adquirir les competències corresponents a aquesta activitat és imprescindible que l’estudiant faci una lectura comprensiva de les pràctiques proposades abans de la seva realització.
Com a activitats supervisades de l'assignatura, els alumnes podran realitzar tutories al despatx del professorat i/o a través de TICs. A l'inici del curs es comunicarà el procediment per a la realització de tutories.
Les activitats autònomes d'aquesta assignatura són: estudi, lectura de textos i resolució de problemes.
Informació addicional: Per un bon seguiment de l’assignatura, l’estudiant disposarà en l'aula Moodle de tota la documentació indicada en els punts anteriors.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Avaluacio de practiques de laboratori | 20% | 1 | 0,04 | 3, 5, 8, 9 |
| Avaluacio de teoria: Parcial 1 | 24% | 2 | 0,08 | 1, 2, 3, 4, 6, 7 |
| Avaluacio de teoria: Parcial 2 | 36% | 2 | 0,08 | 1, 2, 3, 4, 6, 7 |
| Avaluació de técniques i problemes | 20% | 1 | 0,04 | 3, 8 |
Avaluació continuada
L’avaluació de l’assignatura serà individual i continuada a través de les següents proves:
Mòdul d’avaluació de les classes teòriques (60% de la nota global). Al llarg del curs es programaran dues proves escrites d’avaluació d’aquest mòdul, les quals són acumulatives; és a dir la segona prova inclourà tots els continguts teòrics de l’assignatura.
- La primera prova tindrà un pes del 24% i la segona del 36% de la nota global de l'assignatura.
- Si l’estudiant obté en la segona prova una nota superior a la de la primera, la nota final d’aquest mòdul serà la de la segona prova.
- Cada prova inclourà una o dues preguntes de resposta curta (amb un valor màxim de 2 punts sobre 10) i un màxim de 60 preguntes tipus test d’elecció múltiple i/o de cert/fals (amb un valor màxim de 9 sobre 10).
Mòdul d’avaluació de les classes sobre metodologia i problemes (20% de la nota global). L’avaluació d’aquesta activitat constarà de les següents proves:
a) Resolució a classe de problemes
b) Una prova escrita al finalitzar el curs que constarà de la resolució d'un màxim de sis problemes i unes preguntes tipus test.
- Aquestes proves tindran un pes de 3 i 7 punts, sobre 10, respectivament. Per superar aquest mòdul s'ha d'obtenir com a mínim un 5 en la prova escrita.
Mòdul d’avaluació de les classes pràctiques de laboratori (20% de la nota global). L’avaluació d’aquesta activitat constarà dedues proves:
a) Habilitat pràctica, la qual consistirà en el lliurament de diferents resultats pràctics al professorat durant cada sessió de laboratori
b) Prova escrita al finalitzar les classes pràctiques de laboratori que consistirà en un màxim de 20 preguntes test sobre el treball realitzat al laboratori.
- Aquestes proves tindran un pes de 4 i 6 punts, sobre 10, respectivament. Per superar aquest mòdul s'ha d'obtenir com a mínim un 5 en la prova escrita.
Per superar l'assignatura s'ha d'obtenir una qualificació de 5 o superior en cada mòdul. Els estudiants que no superin alguna de les proves escrites dels mòduls de pràctiques i metodologia i problemes les podran recuperar en la data programada per a l'avaluació de l'assignatura al final del semestre. La recuperació del mòdul de teoria es farà en una única prova global escrita.
Per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final".
Els estudiants que vulguin millorar nota podran presentar-se a un examen global de l'assignatura, el qual inclourà preguntes dels tres mòduls. En aquest cas, la presentació de l'estudiant a l'examen de millora comporta la renúncia a la qualificació obtinguda prèviament. La data d'aquests examen sera la mateixa que la de recuperació.
A partir de la segona matrícula de l’assignatura no caldrà que l’alumne realitzi el mòdul de pràctiques de laboratori siva assolir les competències d’aquesta part del’assignatura en el curs anterior. Aquesta exempció es mantindrà per un període de tres matrícules addicionals.
Avaluació Única
L’avaluació única consisteix en una única prova de síntesi en la que s’avaluaran els continguts de tot el programa de teoria de l'assignatura. La prova constarà de preguntes de resposta curta dirigides a valorar si s’han assolit els objectius conceptuals clau de l’assignatura i preguntes tipus test d'elecció múltiple i/o de cert/fals, que permetran valorar una gran part dels continguts. La nota obtinguda en aquesta prova de síntesi suposarà el 60% de la nota final de l’assignatura i ha de ser igual o superior a 5. L’avaluació única es farà el mateix dia que el 2n parcial de l’assignatura.
L’avaluació del mòdul de practiques de laboratori i pràctiques d’aula (problemes) seguirà el mateix procés que l’avaluació continuada. La nota obtinguda suposarà el 20 % de la nota final de l’assignatura per cada un dels mòduls. El mòdul de pràctiques de laboratori és d’assistència obligatòria a totes les sessions. És requisit tenir aprovat el mòdul de pràctiques de laboratori i de pràctiques d'aula (nota de 5 o superior) per a poder fer la prova d’avaluació única.
Bibliografia
Llibres de text:
Madigan, M.T., J.M. Martinko, K.S. Bender, D.H. Buckely, D.A. Stahl. 2015. Brock Biología de los Microorganismos. 14ª ed. Pearson Educación, S.A. ISBN:9788490352793. Recurs electrònic.
Madigan MT, Bender KS Buckley DH, Sattley WM, Stahl DA (2021). Brock. Biology of microorganisms, 16ª ed., Pearson SA.
Martín A, Bejar V, Guitiérrez JC, Llagostera M, Quesada E. 2018. Microbiología Esencial. Panamericana. ISBN 9788498357868. Recurs electrònic
Willey J., L. Sherwood, C.J. Woolverton. 2017. Prescott's Microbiology, 10th ed. McGraw-Hill Education. ISBN: 9781259669934.
Willey, J, LM Sherwood, CJ Woolverton. 2009. Microbiología de Prescott, Harley y Klein. 7ª ed. MacGraw-Hill-Interamericana de España.ISBN: 978-84-481-6827-8.
https://bibcercador.uab.cat/discovery/search?search_scope=CourseReserves&vid=34CSUC_UAB:VU1&query=course_code,contains,100852
Blogs:
Esos pequeños bichitos
http://weblogs.madrimasd.org/microbiologia/
Blog Small things considered
http://schaechter.asmblog.org/schaechter/
Webs:
http://www.microbeworld.org/
http://weblogs.madrimasd.org/microbiologia/archive/2007/12/23/81281.aspx
http://microbewiki.kenyon.edu/index.php/MicrobeWiki
http://serc.carleton.edu/microbelife/
http://web.mst.edu/~microbio/Bio221.html
http://curiosidadesdelamicrobiologia.blogspot.com/
http://weblogs.madrimasd.org/microbiologia/
http://www.topix.com/science/microbiology
http://microbiologybytes.wordpress.com/
http://www.cellsalive.com/
http://commtechlab.msu.edu/sites/dlc-me/
http://commtechlab.msu.edu/sites/dlc-me/zoo/
http://www.microbiologia.com.ar/
En aquest enllaç, es podentrobar els recursos que ha preparat el Servei de Biblioteques per facilitar la localització de llibres electrònics:
https://ddd.uab.cat/pub/guibib/224929/bibrecdigitals.pdf
Programari
No es necessita un programari específic en aquesta assignatura
Llista d'idiomes
| Nom | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 221 | Català | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 222 | Català | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 221 | No definit | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 222 | No definit | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 223 | No definit | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (TE) Teoria | 22 | Català | segon quadrimestre | matí-mixt |