Genòmica i Proteòmica Avançades
Codi: 43473 Crèdits: 9| Titulació | Tipus | Curs | Semestre |
|---|---|---|---|
| 4313794 Bioquímica, Biologia Molecular i Biomedicina | OT | 0 | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Julia Lorenzo Rivera
- Correu electrònic:
- julia.lorenzo@uab.cat
Idiomes dels grups
Podeu accedir-hi des d'aquest enllaç. Per consultar l'idioma us caldrà introduir el CODI de l'assignatura. Tingueu en compte que la informació és provisional fins a 30 de novembre de 2023.
Equip docent
- Francesc Xavier Avilés Puigvert
- Antoni Barbadilla Prados
- Enric Querol Murillo
- Jaime Luis Martinez Urtaza
- Julia Lorenzo Rivera
- Sonia Casillas Viladerrams
Prerequisits
Las classes seran majoritàriament en català, espanyol o anglès, depenent del professor o professora que doni un determinat tema i el conjunt d’alumnat.
Per a postgraduats/postgraduades en Bioquímica, Biotecnologia, Biologia, Biomedicina, Genètica, Microbiologia, Química, Informàtica/Bioinformàtica, Farmàcia, Medicina i Veterinària.
Objectius
L’objectiu bàsic és proporcionar al estudiantat una visió general de la GENÒMICA i PROTEÒMICA incloent-hi els fonaments, tècniques habituals i aplicacions. Els objectius específics de Genòmica tractaran els següents aspectes: la diversitat i complexitat dels genomes eucariotes, una perspectiva històrica i de l’evolució del contingut genòmic, el significat i conseqüències de la variabilitat interespecífica, les tècniques habituals emprades en els estudis de genòmica i transcriptòmica i diverses aplicacions derivades del coneixement d’aquesta ciència.
L'objectiu de les classes de PROTEÒMICA és la introducció als nous mètodes de proteòmica i interactómica i la seva aplicació en la recerca biomèdica i a comprendre com les proteïnes interactuen i es regulen entre si, com canvien en resposta a malalties o tractaments, i com aquestes alteracions poden ser utilitzades per a diagnosticar malalties, identificar biomarcadores o desenvolupar nous enfocaments terapèutics.
Competències
- Analitzar i interpretar correctament els mecanismes moleculars que operen en els éssers vius i identificar-ne les aplicacions.
- Desenvolupar el raonament crític en l'àmbit d'estudi i i en relació amb l'entorn científic o empresarial.
- Identificar i utilitzar les eines bioinformàtiques per a resoldre problemes relacionats amb la bioquímica, la biologia molecular i la biomedicina.
- Integrar els continguts en bioquímica, biologia molecular, biotecnologia i biomedicina des del punt de vista molecular.
- Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
- Que els estudiants sàpiguen comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats
- Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit
- Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics relacionats amb la bioquímica, la biologia molecular o la biomedicina.
- Utilitzar terminologia científica per a argumentar els resultats de la recerca i saber comunicar-los oralment y per escrit.
Resultats d'aprenentatge
- Descriure i identificar els diferents components presents en els genomes i proteomes procariotes i eucariotes.
- Desenvolupar el raonament crític en l'àmbit d'estudi i i en relació amb l'entorn científic o empresarial.
- Identificar molècules que intervenen en funcions biològiques importants i la seva variació en situacions de malaltia.
- Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
- Que els estudiants sàpiguen comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats
- Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit
- Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics relacionats amb la bioquímica, la biologia molecular o la biomedicina.
- Utilitzar les diferents metodologies, tècniques i eines utilitzades habitualment en la seqüenciació, acoblament i anotació dels genomes.
- Utilitzar les diferents metodologies, tècniques i eines utilitzades habitualment en proteòmica i interactòmica i metabolòmica.
- Utilitzar terminologia científica per a argumentar els resultats de la recerca i saber comunicar-los oralment y per escrit.
Continguts
GENÒMICA: Introducció a la Genòmica. El projecte genoma. Tecnologies genòmiques. Elements transponibles. Genòmica comparada: canvis a nivell nucleotídic. Genòmica comparada: canvis cromosòmics. Genòmica de poblacions: Teoria. Genòmica de poblacions en espècies model. Variació nucleotídica en humans. Variació estructural. Estudis d’associació/Genètica de sistemes. Genòmica i transcriptòmica funcionals. Epigenòmica.
PROTEÒMICA: Instrumentació i mètodes de la proteòmica. Sessió de pràctiques de proteòmica. Introducció a la proteòmica biomèdica i les seves aplicacions: biomarcadors en biomedicina; identificació de dianes farmacològiques; proteïnes Moonlighting en malalties humanes i en disseny de vacunes. Interactòmica i el paper de les interaccions proteiques en la malaltia. Aplicacions de la proteòmica a la medecina personalitzada.
Metodologia
El màster inclou tres tipus d’activitats:
- Classes. Exposicions per part dels professors d’un tema mitjançant power point.
- Anàlisi i discussió d’articles d’investigació per part dels estudiants.
- Presentacions orals/power point per part dels estudiants d’un tema concret d’interès.
Es dedicaran 15 minuts d'una classe a respondre a les enquestes institucionals de la UAB.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Activitats formatives
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Conferències | 45 | 1,8 | 3, 4, 10 |
| Tipus: Supervisades | |||
| Presentacions orals | 40 | 1,6 | 5, 7, 10 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Estudi i treball de l'estudiant | 137 | 5,48 | 2, 3, 4, 6, 7, 10 |
Avaluació
Assignatura d´avaluació continuada (no hi ha opció d´avaluació única)
El procés d’avaluació continuada ha d'incloure un mínim de tres activitats avaluatives, de dues tipologies diferents, distribuïdes al llarg del curs, cap de les quals pot representar més del 50% de la qualificació final
per tant la nota final és la mitja de:
- Assistència a classe i participació (20%). No recuperable.
- Presentacions orals (40%).
- Examen (40%).
En cas de que l´alumne no arribi al 5 per superar l´assignatura podrà participar en una proba final de recuperació, per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final".
Important: Si es detecta plagi en algun del treballs entregats podrà comportar que el alumne suspengui el mòdul sencer.
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Assistència a classe | 20% | 0 | 0 | 4, 5 |
| Examen | 40% | 2 | 0,08 | 1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10 |
| Presentació oral | 40% | 1 | 0,04 | 4, 5, 7 |
Bibliografia
Expasy: http://www.expasy.org
Human Proteome Map: http://www.humanproteomemap.org/
ProteomicsDB: : http://www.proteomicsdb.org/
Programari
No s´utilitza