Titulació | Tipus | Curs | Semestre |
---|---|---|---|
4313794 Bioquímica, Biologia Molecular i Biomedicina | OT | 0 | 1 |
Llicenciats o graduats en Bioquímica, Biotecnologia, Biologia, Ciències Biomèdiques, Genètica, Microbiologia, Química, Informàtica, Física, Veterinària, Farmàcia o Medicina.
- L’objectiu general del curs és proporcionar una introducció de les diferents tècniques biofísiques emprades a la recerca en Biomedicina. S'espera que l'alumne assoleixi un nivell de coneixements que li permetin entendre la utilitat del conjunt de tècniques i tecnologies biofísiques per a l'anàlisi estructural i funcional de macromolècules (proteïnes, lípids, àcids nucleics, sucres, complexos macromoleculars), d'acord amb l'estat actual de desenvolupament d'aquestes tècniques, i la seva importància en relació a les aplicacions biomèdiques.
- Un dels principals objectius és la formació en el coneixement necessari per la resolució d'estructures tridimensional de proteïnes i de complexos proteics per cristal.lografia de raigs X mitjançant l'ús de llum de sincrotró. Al finalizar el curs l'alumne haurà adquirit el coneixement de les bases teòriques per la resolució d'estructures atòmiques de proteïnes, així com els coneixements pràctics en el laboratori per la cristal.lització i resolució d'estructures tridimensionals per difracció de raigs X.
- Així, mateix en finalitzar el mòdul l’alumne haurà assolit un sòlid coneixement dels mètodes experimentals i teòrics utilitzats actualment per a l’estudi d’aquestes propietats i de la seva interelació.
- Dinàmica estructural
- dicroisme circular
- Dispersió dinàmica de la llum (DLS). Conceptes teòrics
- Interactòmica: Bases de les interaccions que les proteïnes estableixen entre elles, tant a nivell binari com massiu
- Estudi estructural per Ressonància Magnètica Nuclear
- Algunes aplicacions de la radiació de sincrotró en biomedicina.
- Caracterització estructural de pèptids i proteïnes relacionades en processos degeneratius i infecció vírica.
- Estructura, dinàmica i topologia del DNA. Aspectes biomèdics.
- Estudi de complexos macromoleculars i d’interaccions entre biomolècules amb tècniques microscòpiques.
- Immunoteràpia amb fragments d'anticossos: dicroisme, espectroscòpia d'infraroig i tècniques de fluorescència aplicades al disseny de proteïnes.
- Estudi de Proteïnes Intrínsecament Desordenades
- Introducció i curs pràctic de preparació de cristalls de proteïnes.
- Curs pràctic d'aplicacions de la Dispersió dinàmica de la llum (DLS)
- Visita a la línia de cristal·lografia de proteïnes del sincrotró ALBA.
- Curs pràctic computacional de resolució de estructures cristal·lines de proteïnes.
- La metodologia de treball combinarà les classes presencials amb el treball autònom de l’estudiant. Es realitzaran classes en la sala d'ordinadors i també un curs d'iniciació en el laboratori a la cristal.lografia de proteïnes. Principalment es pretén que el curs tingui un caire més pràctic que no pas teòric. També es visitarà el sincrotró ALBA amb una explicació del seu ús en la difracció de raigs X per la cristal.lografia de proteïnes.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
---|---|---|---|
Tipus: Dirigides | |||
Coneixement dels diferents mètodes biofísics i identificació de les propietats de les biomècules | 70 | 2,8 | 2, 3, 5, 6 |
Tipus: Supervisades | |||
Processament dades de difracció raigs X i reconstrucció d'estructures de proteïnes per ordinador | 35 | 1,4 | 7, 8, 9 |
Tipus: Autònomes | |||
Aplicació dels coneixements obtinguts | 35 | 1,4 | 10, 14, 15 |
Comunicació científica | 30 | 1,2 | 11, 16 |
Desenvolupar noves idees en la recerca i raonament crític | 52 | 2,08 | 1, 4, 12, 13 |
- L’avaluació del mòdul es farà a partir de l’assistència (que és obligatòria), la participació a classe, l'avaluació continuada i d’un breu examen que es realitzarà el darrer dia sobre els contiguts principals de l’assignatura.
Càlcul de la qualificació final:
Nota final = T* 0,50 + Av* 0,3 + PC* 0,2
T (nota final de teoria)
Av (nota avaluació continuada)
PC (nota participació a classe)
- Es considerarà "no avaluable" quan les actividats d'avaluació (prova final i assistència) no permetin obtindre una nota global mínima de 5,0.
Important: Si es detecta plagi en algun del treballs entregats podrà comportar que el alumne suspengui el mòdul sencer.
Hi haurà també la possibilitat de realitzar una prova de recuperació un cop finalitzat el mòdul
Per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final
Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
---|---|---|---|---|
Avaluació continuada | 30 | 1,12 | 0,04 | 1, 2, 3, 5, 6, 7, 8, 9, 14, 15 |
Realització d'una prova escrita | 50 | 1,88 | 0,07 | 1, 2, 3, 5, 6, 7, 8, 9, 14, 15 |
Seguiment i participació activa a classe | 20 | 0 | 0 | 4, 10, 11, 12, 13, 16 |
- Cada professor indicarà la bibliografia corresponent de la seva part al seu bloc.
Documentació digital:
Integrative structural biology with hybrid methods / Haruki Nakamura, Gerard Kleywegt, Stephen K. Burley, John L. Markley, editors. Llibre en línia | 2018
Enllaços:
http://www-structmed.cimr.cam.ac.uk/course.html
http://www.xtal.iqfr.csic.es/Cristalografia/index-en.html
UCSF Chimera; VMD; CCP4 interfase package; Coot; Phenix; Pymol.