2020/2021
Genòmica Vegetal
Codi: 43865
Crèdits: 6
Titulació |
Tipus |
Curs |
Semestre |
4316231 Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology |
OB |
0 |
1 |
La metodologia docent i l'avaluació proposades a la guia poden experimentar alguna modificació en funció de les restriccions a la presencialitat que imposin les autoritats sanitàries.
Utilització d'idiomes a l'assignatura
- Llengua vehicular majoritària:
- anglès (eng)
Equip docent
- Jordi García Mas
- Maria Jose Aranzana Civit
- Pere Arus
- Werner Howad
- Raul Castanera Andres
- Albert Ferrer Prats
- Cristina Roquet Ruíz
Equip docent extern a la UAB
- Riccardo Aiese
Prerequisits
Bon domini de l'anglès
Bona experiència en genètica, biologia molecular i enginyeria genètica
Objectius
Proporcionar una visió global i actualitzada de les bases teòriques i tecnològiques relacionades amb l'estudi de l'organització, la funció i l'evolució dels genomes de les plantes i les seves aplicacions potencials per a la millora genètica de les plantes de cultiu.
Competències
- Aplicar els coneixements de genètica molecular de les plantes en diferents àmbits científics i industrials.
- Aplicar els coneixements dels mecanismes funcionals de les plantes, des dels diferents nivells organitzatius, a la caracterització dels processos de creixement i desenvolupament de l’organisme vegetal sencer.
- Desenvolupar el raonament crític en l’àmbit d’estudi i en relació amb l’entorn científic i empresarial.
- Identificar i utilitzar eines bioinformàtiques per aplicar-les a l’estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals.
- Que els estudiants siguin capaços d'integrar coneixements i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis a partir d'una informació que, tot i ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.
- Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
- Que els estudiants sàpiguen comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats.
- Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit.
- Sintetitzar, analitzar alternatives i debatre críticament.
- Treballar en un equip multidisciplinari.
- Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics en l’àmbit d’estudi.
- Utilitzar terminologia científica per argumentar els resultats de la recerca i comunicar-los en anglès oralment i per escrit en un entorn internacional.
Resultats d'aprenentatge
- Aplicar aproximacions de tipus “òmiques” a la identificació de nous gens i processos d’interès en investigació bàsica i aplicada.
- Aplicar eines bioinformàtiques a l’estudi de la sistemàtica i filogènia vegetal.
- Aplicar els coneixements de genòmica vegetal a l’estudi dels mecanismes evolutius i la sistemàtica de plantes i fongs.
- Aplicar els coneixements derivats de la identificació de la funció de nous gens en recerca bàsica i aplicada.
- Aplicar estratègies de seqüenciació i anotació de genomes.
- Descriure l’organització i la funció dels genomes vegetals.
- Desenvolupar el raonament crític en l’àmbit d’estudi i en relació amb l’entorn científic i empresarial.
- Que els estudiants siguin capaços d'integrar coneixements i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis a partir d'una informació que, tot i ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.
- Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
- Que els estudiants sàpiguen comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats.
- Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit.
- Seleccionar i aplicar eines bioinformàtiques a estudis genòmics.
- Sintetitzar, analitzar alternatives i debatre críticament.
- Treballar en un equip multidisciplinari.
- Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics en l’àmbit d’estudi.
- Utilitzar terminologia científica per argumentar els resultats de la recerca i comunicar-los en anglès oralment i per escrit en un entorn internacional.
Continguts
- Organització i funció del genoma de plantes.
- Estratègies de seqüenciació i anotació genòmica.
- Eines bioinformàtiques aplicades a estudis genòmics.
- Evolució molecular de les plantes.
- Marcadors genètics i millorament molecular.
- Anàlisi i funció de transcrits.
“*Llevat que les restriccions imposades per les autoritats sanitàries obliguin a una priorització o reducció d’aquests continguts.”
Metodologia
- Sessions teòriques que cobreixen els diferents temes del programa. Les presentacions de PowerPoint estaran disponibles, amb antelació, al Campus Virtual UAB.
- Lectura de treballs de recerca seleccionats per a la seva presentació i discussió en les sessions del seminaris.
- Sessions pràctiques sobre eines bioinformàtiques aplicades a estudis genòmics.
- Visita al Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica (CNAG-CRG) al Parc Científic de Barcelona.
"*La metodologia docent proposada pot experimentar alguna modificació en funció de les restriccions a la presencialitat que imposin les autoritats sanitàries.”
Avaluació
Informes escrits (examen i exercicis sobre bionformática).
Presentació oral i defensa de sessió de seminari.
Assistència i participació en les classes i sessions de seminaris.
El estudiant no serà "qualificat" quan la qualificació de les diferents avaluacions no arribi a una qualificació mínima de 5.0 (sobre 10).
*L’avaluació proposada pot experimentar alguna modificació en funció de les restriccions a la presencialitat que imposin les autoritats sanitàries.
Activitats d'avaluació
Títol |
Pes |
Hores |
ECTS |
Resultats d'aprenentatge |
Assistència i participació en les classes i sessions de seminaris |
10% |
0
|
0 |
7, 13, 14
|
Informes escrits (examen i exercicis sobre bionformàtica). |
60% |
1
|
0,04 |
1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 16
|
Presentació oral i defensa com a sessió de seminari |
30% |
0
|
0 |
8, 10, 13, 15, 16
|
Bibliografia
Es proporcionarà bibliografia específica (llibres, capítols de llibres i publicacions de revistes) i enllaços útils relacionats amb Genómica de plantes per a les diferents sessions del programa.