Logo UAB
2020/2021

Genòmica Vegetal

Codi: 43865 Crèdits: 6
Titulació Tipus Curs Semestre
4316231 Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology OB 0 1
La metodologia docent i l'avaluació proposades a la guia poden experimentar alguna modificació en funció de les restriccions a la presencialitat que imposin les autoritats sanitàries.

Professor/a de contacte

Nom:
Narciso Campos Martinez
Correu electrònic:
Desconegut

Utilització d'idiomes a l'assignatura

Llengua vehicular majoritària:
anglès (eng)

Equip docent

Jordi García Mas
Maria Jose Aranzana Civit
Pere Arus
Werner Howad
Raul Castanera Andres
Albert Ferrer Prats
Cristina Roquet Ruíz

Equip docent extern a la UAB

Riccardo Aiese

Prerequisits

Bon domini de l'anglès

Bona experiència en genètica, biologia molecular i enginyeria genètica

Objectius

Proporcionar una visió global i actualitzada de les bases teòriques i tecnològiques relacionades amb l'estudi de l'organització, la funció i l'evolució dels genomes de les plantes i les seves aplicacions potencials per a la millora genètica de les plantes de cultiu.

Competències

  • Aplicar els coneixements de genètica molecular de les plantes en diferents àmbits científics i industrials.
  • Aplicar els coneixements dels mecanismes funcionals de les plantes, des dels diferents nivells organitzatius, a la caracterització dels processos de creixement i desenvolupament de l’organisme vegetal sencer.
  • Desenvolupar el raonament crític en l’àmbit d’estudi i en relació amb l’entorn científic i empresarial.
  • Identificar i utilitzar eines bioinformàtiques per aplicar-les a l’estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals.
  • Que els estudiants siguin capaços d'integrar coneixements i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis a partir d'una informació que, tot i ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.
  • Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
  • Que els estudiants sàpiguen comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats.
  • Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit.
  • Sintetitzar, analitzar alternatives i debatre críticament.
  • Treballar en un equip multidisciplinari.
  • Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics en l’àmbit d’estudi.
  • Utilitzar terminologia científica per argumentar els resultats de la recerca i comunicar-los en anglès oralment i per escrit en un entorn internacional.

Resultats d'aprenentatge

  1. Aplicar aproximacions de tipus “òmiques” a la identificació de nous gens i processos d’interès en investigació bàsica i aplicada.
  2. Aplicar eines bioinformàtiques a l’estudi de la sistemàtica i filogènia vegetal.
  3. Aplicar els coneixements de genòmica vegetal a l’estudi dels mecanismes evolutius i la sistemàtica de plantes i fongs.
  4. Aplicar els coneixements derivats de la identificació de la funció de nous gens en recerca bàsica i aplicada.
  5. Aplicar estratègies de seqüenciació i anotació de genomes.
  6. Descriure l’organització i la funció dels genomes vegetals.
  7. Desenvolupar el raonament crític en l’àmbit d’estudi i en relació amb l’entorn científic i empresarial.
  8. Que els estudiants siguin capaços d'integrar coneixements i enfrontar-se a la complexitat de formular judicis a partir d'una informació que, tot i ser incompleta o limitada, inclogui reflexions sobre les responsabilitats socials i ètiques vinculades a l'aplicació dels seus coneixements i judicis.
  9. Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
  10. Que els estudiants sàpiguen comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats.
  11. Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit.
  12. Seleccionar i aplicar eines bioinformàtiques a estudis genòmics.
  13. Sintetitzar, analitzar alternatives i debatre críticament.
  14. Treballar en un equip multidisciplinari.
  15. Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics en l’àmbit d’estudi.
  16. Utilitzar terminologia científica per argumentar els resultats de la recerca i comunicar-los en anglès oralment i per escrit en un entorn internacional.

Continguts

- Organització i funció del genoma de plantes.

- Estratègies de seqüenciació i anotació genòmica.

- Eines bioinformàtiques aplicades a estudis genòmics.

- Evolució molecular de les plantes.

- Marcadors genètics i millorament molecular.

- Anàlisi i funció de transcrits.

“*Llevat que les restriccions imposades per les autoritats sanitàries obliguin a una priorització o reducció d’aquests continguts.”

Metodologia

- Sessions teòriques que cobreixen els diferents temes del programa. Les presentacions de PowerPoint estaran disponibles, amb antelació, al Campus Virtual UAB.

- Lectura de treballs de recerca seleccionats per a la seva presentació i discussió en les sessions del seminaris.

- Sessions pràctiques sobre eines bioinformàtiques aplicades a estudis genòmics.

- Visita al Centre Nacional d'Anàlisi Genòmica (CNAG-CRG) al Parc Científic de Barcelona.

 

"*La metodologia docent proposada pot experimentar alguna modificació en funció de les restriccions a la presencialitat que imposin les autoritats sanitàries.”

Activitats formatives

Títol Hores ECTS Resultats d'aprenentatge
Tipus: Dirigides      
Classes teòriques 23 0,92 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 12, 15
Pràctiques de laboratori informàtic 12 0,48 1, 2, 3, 5, 9, 12, 14, 15
Seminaris 4 0,16 3, 7, 8, 9, 10, 13, 14, 16
Tipus: Supervisades      
Preparació de presentacions orals 30 1,2 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 15, 16
Tipus: Autònomes      
Treball d'estudi i aprenentatge 80 3,2 7, 9, 11, 13, 14

Avaluació

Informes escrits (examen i exercicis sobre bionformática).

Presentació oral i defensa de sessió de seminari.

Assistència i participació en les classes i sessions de seminaris.

El estudiant no serà "qualificat" quan la qualificació de les diferents avaluacions no arribi a una qualificació mínima de 5.0 (sobre 10).

 

*L’avaluació proposada pot experimentar alguna modificació en funció de les restriccions a la presencialitat que imposin les autoritats sanitàries.

Activitats d'avaluació

Títol Pes Hores ECTS Resultats d'aprenentatge
Assistència i participació en les classes i sessions de seminaris 10% 0 0 7, 13, 14
Informes escrits (examen i exercicis sobre bionformàtica). 60% 1 0,04 1, 2, 3, 4, 5, 6, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 16
Presentació oral i defensa com a sessió de seminari 30% 0 0 8, 10, 13, 15, 16

Bibliografia

Es proporcionarà bibliografia específica (llibres, capítols de llibres i publicacions de revistes) i enllaços útils relacionats amb Genómica de plantes per a les diferents sessions del programa.