Biologia de Sistemes de les Plantes
Codi: 44787 Crèdits: 6| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| 4318297 Biologia, Genòmica i Biotecnologia Vegetals / Plant Biology, Genomics and Biotechnology | OT | 0 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Ana Montserrat Martin Hernandez
- Correu electrònic:
- anamontserrat.martin@uab.cat
Equip docent
- Luisa Maria Lois Rojas
- Juan Jose Lopez-Moya Gomez
- Elena Monte Collado
- (Extern) Antoni Gacia-Molina
- (Extern) Iban Eduardo
- (Extern) Jae-Seong Yang
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Coneixements basics de Genètica
Objectius
Proporcionar als alumnes una visió global i actual de les tècniques, fonaments i aplicacions de la Genòmica
Vegetal i introduir-los en la Biologia de Sistemes de les plantes. Els objectius específics inclouen la
comprensió dels següents aspectes: la diversitat i complexitat dels genomes vegetals, les tècniques emprades
habitualment en els estudis de genòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica i les aplicacions a la
millora genètica de les plantes de conreu. Us de les matemàtiques per el modelat predictiu mitjanant
d'integració de diferents dades -omiques
Resultats d'aprenentatge
- CA12 (Competència) Utilitzar noves eines bioinformàtiques per a descriure models predictius de dades experimentals òmiques en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals.
- CA17 (Competència) Aplicar la terminologia científica per a argumentar els resultats de la investigació en la millora genètica de plantes de cultiu i comunicar-los oralment i per escrit en un entorn internacional.
- KA15 (Coneixement) Descriure els resultats de les anàlisis de dades derivades d'estudis proteòmics i metabolòmics aplicats a la millora de plantes de cultiu.
- KA16 (Coneixement) Seleccionar metodologies d'estudi en genòmica vegetal i estudi de casos pràctics a través de múltiples òmiques.
- SA28 (Habilitat) Comunicar els resultats de la investigació en l'àmbit de la biologia, la genòmica i la biotecnologia vegetals en anglès, oralment i per escrit, utilitzant una terminologia científica adequada.
- SA29 (Habilitat) Aplicar els coneixements de genètica molecular i la millora de les plantes de cultiu en diferents àmbits científics i industrials.
- SA30 (Habilitat) Aplicar els mètodes i les tècniques usats habitualment en els estudis de genòmica, fenòmica, transcriptòmica, proteòmica i metabolòmica.
- SA31 (Habilitat) Aplicar eines bioinformàtiques a l'estudi genètic, evolutiu i funcional dels vegetals i interpretar els resultats obtinguts dels experiments duts a terme.
Continguts
Biologia de sistemes: conceptes, metodologia i estudis de casos utilitzant múltiples omiques. El cas d'estudi
serà l'aparició d'una nova malaltia que afecta i mata totes les varietats de tomàquet. Els estudiants realitzaran
un viatge a través de totes les -omiques per descobrir la causa i buscar una solució científica viable per a la
seva aplicació en la millora de plantes de cultiu.
Concretament:
Utilitzarem aplicacions pràctiques de mètodes i tècniques en fenòmica i genòmica vegetals, incloent l'ús de
marcadors moleculars en la millora vegetal. Importància dels QTLs en aquest problema.
Anàlisi i aplicació de dades derivades dels estudis de genòmica i de transcriptòmica per limitar el problema.
Anàlisi i aplicació de dades derivades dels estudis de proteòmica, interactòmica i metabolòmica per trobar una
solució al problema.
Anàlisi integrativa del cas de l'estudi aplicats, inclosa la modelització computacional, per a la millora de plantes
de conreu.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Conferencies i xerrades d'experts | 12 | 0,48 | |
| Problemes i casos pràctics | 18 | 0,72 | |
| Tipus: Supervisades | |||
| Preparació d'informes | 35 | 1,4 | |
| Tipus: Autònomes | |||
| Estudi personal | 84 | 3,36 |
Conferències i xerrades d'experts
Problemes i casos pràctics
Preparació d'informes
Estudi personal
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Conferencies i xerrades d'experts | 10% | 0 | 0 | CA12, CA17 |
| Informe | 60% | 0 | 0 | CA17, KA15, KA16, SA28 |
| Qüestionari final | 30% | 1 | 0,04 | CA17, SA29, SA30, SA31 |
Avaluació continua 10%
Informe 60%
Qüestionari final 30%
Aquesta assignatura/mòdul no preveu el sistema d’avaluació única.
Bibliografia
Yunbi Xu Molecular Plant Breeding. CAB International Oxfordshire, UK disponible online a Biblioteca UAB
:http://www.cabi.org/cabebooks/FullTextPDF/2010/20103101750.pdf
Articles i revisions específiques recomanats a classe
Programari
MapQTL 6.0
JoinMap 5.0
R
RStudio
Llista d'idiomes
| Nom | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (PAULm) Pràctiques d'aula (màster) | 1 | Anglès | segon quadrimestre | matí-mixt |
| (TEm) Teoria (màster) | 1 | Anglès | segon quadrimestre | matí-mixt |