Titulació | Tipus | Curs |
---|---|---|
2500502 Microbiologia | OB | 3 |
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
S’aconsella a l'alumnat revisar els continguts científico-teòrics sobre els quals es basa aquesta assignatura.
Així mateix convé cursar aquesta assignatura de manera simultània o amb posterioritat a la resta d’assignatures programades per al segon semestre del tercer curs del grau en Microbiologia.
Per poder cursar aquesta assignatura cal que l’alumnat hagi superat la prova de seguretat i de bioseguretat que trobarà en el corresponent espai docent del campus virtual. La informació que cal consultar per superar aquestes proves es troba a l’espai de comunicació del grau en Microbiologia. A més a més, és imprescindible que l'alumnat segueixi la normativa de treball que indiqui el professorat i que accepti i segueixi les normes de funcionament dels laboratoris docents de la Facultat de Biociències.
Per raons de seguretat, si no s’han superat els dos tests de seguretat i de bioseguretat, o bé si no es porten bata i ulleres de seguretat no es permetrà l’accés al laboratori.
Es tracta d’una assignatura obligatòria de tercer curs, nuclear del grau en Microbiologia, que introdueix a l'alumnat en l’ús d’un conjunt de tècniques bàsiques de microbiologia per a l’experimentació en un laboratori de microbiologia industrial i microbiologia ambiental. Els coneixements assolits en aquesta assignatura permetran a l’alumnat adquirir les competències d’altres d’assignatures pràctiques o teòriques que conformen el grau en Microbiologia i que estan programades perquè se segueixin simultàniament o amb posterioritat.
Els objectius concrets que l'alumnat ha d'assolir es defineixen en els punts següents:
1.- L’alumnat es familiaritzarà amb les tècniques d’aïllament i selecció de microorganismes d’interès industrial.
2.- L’alumnat manipularà un microorganisme per convertir-lo en productor d’una activitat industrial d’interès utilitzant mètodes moleculars.
3.- L’alumnat realitzarà un procés d’obtenció d’un producte d’interès industrial.
4.- L’alumnat analitzarà la qualitat microbiològica de l’aire i de les superfícies de les instal·lacions de pràctiques com a model.
5.- L’alumnat determinarà la qualitat microbiològica de l’aigua.
6.- L’alumnat avaluarà l’efecte desinfectant de productes químics.
7.- L’alumnat es familiaritzarà amb la metodologia per convertir residus industrials en productes d’alt contingut proteic.
8.- L’alumnat seleccionarà i avaluarà l’activitat dels microorganismes implicats en el bioremei de sòls.
9.- L’alumnat demostrarà l’acció de bacteris sobre la inhibició del creixement de fongs fitopatògens.
10.- L’alumnat recollirà, analitzarà i interpretarà les dades obtingudes durant les pràctiques
11.- L’alumnat exposarà de manera concisa els resultats i les conclusions derivades de les pràctiques realitzades en grup.
12.- L’alumnat es familiaritzarà en l’ús d’una llibreta de laboratori per elaborar informes en els que es pugui traçar tota l'activitat realitzada.
13.- L’alumnat descriurà els procediments de bones pràctiques de laboratori i Bioseguretat amb microorganismes utilitzats en la microbiologia industrial i ambiental.
Els resultats d’aprenentatge específics per aquesta assignatura són:
1.- Saber aïllar i seleccionar microorganismes d’interès industrial a partir d’una col·lecció de microorganismes (associat a l’RA: SM26).
2.- Manipular un microorganisme per convertir-lo en productor d’una activitat industrial d’interès utilitzant mètodes moleculars (associat a l’RA: SM27).
3.-Desenvolupar un procés d’obtenció d’un producte d’interès industrial a partir de microorganismes transformats (associat a l'RA: SM28).
4.-Determinar la qualitat microbiològica de l’aire i de les superfícies d’instal·lacions industrials (associat a l’RA: SM25).
5.-Determinar la qualitat microbiològica de l’aigua independentment de l’origen (associat a l’RA: SM25).
6.-Descriure l’efecte desinfectant de productes químics (associat a l’RA: KM25).
7.-Convertir residus industrials en productes d’alt contingut proteic utilitzant el concepte “single-cell protein” (associat a l’RA: SM28).
8.-Seleccionar iavaluar l’activitat dels microorganismes implicats en el bioremei de sòls (associat a l’RA: SM27).
9.-Demostrar l’acció de bacteris sobre la inhibició del creixement de fongs fitopatògens (associat a l’RA: SM27).
10.-Analitzar les dades experimentals de la microbiologia industrial i ambiental amb recursos informàtics (associat a l’RA: SM25).
11.-Exposar de manera concisa els resultats i les conclusions derivades de les pràctiques realitzades en grup (associat a l’RA: CM17).
12.-Elaborar informes de laboratori en els que es pugui traçar tota l'activitat realitzada de manera individual o en grup (associat a l’RA: CM18).
13.-Descriure la metodología emprada al laboratori per manipular microorganismes en l’àmbit de la microbiologia industrial i ambiental tenint en compte els aspectes de bones pràctiques de laboratori i la bioseguretat (associat a l’RA: KM26).
L’assignatura es divideix en els mòduls següents:
Mòdul 1: Microbiologia industrial
Mòdul 2: Microbiologia ambiental
Cada mòdul té una durada aproximada de 24 hores.
Mòdul 1: Microbiologia industrial
Continguts: aquest mòdul consta de set sessions i se centra en l’aïllament i l’ús de microorganismes per obtenir un producte d’interès industrial.
Les pràctiques d'aquest mòdul es faran obligatòriament sota la normativa de treball que s’indicarà quan s'inicïin.
1. Aïllament i selecció de microorganismes d'interès industrial-MI1
2. Cribratge per activitat-MI2
3. Aïllament de gens d'interès industrial-MI3
4. Clonació en vectors de sobreexpressió-MI4
5. Desenvolupament del mètode de producció-MI5
6. Valoració-MI6
Mòdul 2: Microbiologia ambiental
Continguts: aquest mòdul consta de vuit sessions centrades en la determinació de la contaminació microbiana ambiental, la utilització dels microorganismes en bioremei i valorització de residus, així com en el control de plagues i malalties vegetals.
1. Gestió de residus
Bioremei d'un sòl contaminat-MA1
Producció de proteïna unicel·lular a partir d'un residu-MA2
2. Control de la contaminació ambiental
Qualitat de l'aire i de les superfícies d'instal·lacions industrials-MA3
Qualitat microbiològica de l'aigua-MA4
Desinfecció de superfícies-MA5
3. Control biològic
Aïllament de bacteris de la fil·losfera.
Determinació del seu potencial com a enemics naturals de patògens vegetals-MA6
Els continguts per sessió que s’impartiran en cadascun dels mòduls són els següents:
Mòdul 1: Microbiologia industrial
MI1
Sessió 1
Enriquiment i aïllament d'Actinomicets de mostres de sòl
Sessió 2
Enriquiment i aïllament de Bacillus de mostres de sòl
Identificació, recompte i aïllament de clons d'Actinomicets
Sessió 3
Identificació, recompte i aïllament de clons de Bacillus
MI2
Sessió 3
Detecció de l'activitat antibiòtica d’Actinomicets-sembra
Detecció de l'activitat enzimàtica d’Actinomicets-sembra
Sessió 4
Detecció de l'activitat antibiòtica de Bacillus-sembra
Detecció de l'activitat enzimàtica de Bacillus-sembra
Sessió 5
Avaluació de l'activitat enzimàtica d'Actinomicets
Detecció de l'activitat antibiòtica d'Actinomicets-sembra en doble capa
Sessió 6
Detecció de l'activitat antibiòtica de Bacillus-sembra en doble capa
Sessió 7
Avaluació de l'activitat antibiòtica de Bacillus
Avaluació de l'activitat enzimàtica de Bacillus
Avaluació de l'activitat antibiòtica d'Actinomicets
Avaluació i discussió de resultats
MI3
Sessió 1
Purificació de DNA genòmic de Bacillus
PCR per a l'amplificació d'un gen d'interès industrial
Sessió 2
Gel de comprovació d'un fragment de DNA del gen d'interès industrial
MI4
Sessió 2
Digestió del vector d'expressió E. coli
Digestió del fragment de DNA del gen d'interès industrial
Defosforil·lació i purificació del vector d'expressió E. coli digerit
Sessió 3
Lligació d'un gen d’interès industrial
Transformació de la lligació
Sessió 4
Detecció de soques productores
MI5
Sessió 5
Inoculació de microorganismes productors d'activitats enzimàtiques d'interès industrial
Sessió 6
Experiment en batch: reinoculació delcultiu i seguiment del creixement de microorganismes productors d'activitats enzimàtiques d'interès industrial
MI6
Sessió 6
Avaluació de la producció i de l'activitat d'enzims d'interès industrial produïts per microorganismes
Sessió 7
Avaluació i discussió de resultats
Mòdul 2:Microbiologia Ambiental
MA1
Sessió 4
Enriquiment i aïllament de bacteris degradadors d'hidrocarburs de mostres de sòl contaminades
Determinació de l'activitat microbiana de mostres de sòl contaminades
Sessió 8
Lectura d'heteròtrofs totals
Detecció de microorganismes degradadors d'hidrocarburs totals
Detecció i recompte de microorganismes degradadors d'hidrocarburs aromàtics policíclics
Detecció de microorganismes degradadors d'n-hexadecà
Sessió 9
Recompte de microorganismes degradadors d'hidrocarburs totals
Recompte de microorganismes degradadors d'n-hexadecà
Avaluació i discussió de resultats
MA2
Sessió 1
Inoculació de bioreactors amb microorganismes en medis amb diferent concentració de sucres
Presa de mostres inicials del cultiu: sembra de viables, sucres, DO
Anàlisi de mostres: sembra de viables i mesura DO
Sessió 2
Presa de mostres del cultiu: sembra de viables, sucres, DO
Anàlisi de mostres: viables, taxa de creixement del cultiu, temps de duplicació, DO, determinació del consum de sucres
Sessió 3
Presa de mostres final
Anàlisi de mostres:
Recomptes i gràfics
Determinació del consum de sucres
Determinació de la biomassa del cultiu
Càlculs
Avaluació i discussió dels resultats
MA3
Sessió 5
Detecció de microorganismes en mostres d'aire
Detecció de microorganismes en mostres de superfícies
Sessió 7
Observació i recompte de microorganismes de mostres d'aire i de superfícies
Avaluació i discussió de resultats
MA4
Sessió 5
Sembra de microorganismes viables de mostres d'aigua
Detecció i recompte de bacteris coliformes i d'Escherichia coli
Detecció i recompte d'enterococs intestinals
Detecció i recompte de Clostridium perfringens
Sessió 6
Avaluació i test de confirmació de la presència d'Escherichia coli
Avaluació i test de confirmació de la presència de Clostridium perfringens
Sessió 7
Avaluació de la presència d’Escherichia coli en mostres d'aigua
Avaluació i test de confirmació de la presència d'enterococs fecals
Sessió 8
Recompte de microorganismes viables de mostres d'aigua
Avaluació i discussió de resultats
MA5
Sessió 6
Detecció de microorganismes en mostres de superfícies desinfectades
Sessió 8
Observació i recompte de microorganismes de superfícies desinfectades
Avaluació i discussió de resultats
MA6
Sessió 5
Aïllament de bacteris epífits de fulles de diferents espècies vegetals
Sessió 6
Obtenció de cultius axènics de bacteris epífits de fulles
Sessió 7
Realització del test de control biològic de fongs per bacteris epífits de fulles
Avaluació dels resultats obtinguts del potencial antagonista dels bacteris epífits de fulles sobre un fong fitopatogen
Avaluació i discussió de resultats
Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
---|---|---|---|
Tipus: Dirigides | |||
Classes pràctiques de laboratori | 45 | 1,8 | CM17, CM18, KM25, KM26, SM25, SM26, SM27, SM28 |
Tipus: Supervisades | |||
Tutoria | 1 | 0,04 | CM17, CM18, KM25, KM26, SM25, SM26, SM27, SM28 |
Tipus: Autònomes | |||
Estudi | 12 | 0,48 | KM25, KM26, SM25, SM26, SM27, SM28 |
Lectura comprensiva del manual de l'assignatura | 5 | 0,2 | KM25, KM26, SM25, SM26, SM27, SM28 |
Redacció de la llibreta de laboratori | 6 | 0,24 | CM17, CM18, SM25 |
preparació presentacions orals | 3 | 0,12 | CM17, CM18, SM25 |
Aquesta assignatura s'impartirà en tres grups reduïts d'estudiants (d'un màxim de 24 estudiants per sessió). Per tal de poder adquirir les competències de l'assignatura l'assistència a les classes és obligatòria. Si un estudiant, per causa justificada i imprevisible (com ara un problema de salut, defunció d'un familiar de fins a segon grau, accident, gaudir de la condició d'esportista d'elit i tenir una competició o activitat esportiva d'obligada assistència, etc) no ha pogut assistir a una sessió de pràctiques o més d'una, haurà de dir-ho al professor o professora responsable i presentar-li el justificant corresponent durant les 48 h posteriors a la sessió a la qual ha faltat (certificat mèdic oficial en què es faci constar explícitament la incapacitat d'assistència a la/les sessió/sessions de pràctiques, atestat policial, justificació de l'organisme esportiu competent, etc.). En cas de convocatòria de vaga, si un estudiant decideix exercir el seu dret de vaga ho haurà de comunicar a la persona responsable de l'assignatura en un període màxim de 48 h després del dia de la vaga. En cap cas l'absència no podrà ser superior al 20 % de les activitats programades. El màxim d'absència en cada un dels mòduls es fixa en un 10 % per poder ser avaluat. En cas que se superi aquest valor, l’assignatura serà qualificada amb un no avaluable.
Els/les estudiants disposaran d’un manual de l’assignatura abans de l'inici de les sessions pràctiques. A cada sessió de pràctiques és obligatori que l’estudiant porti la seva pròpia bata, ulleres de laboratori, retolador permanent, calculadora i el manual de l’assignatura que trobarà disponible al campus virtual, assignatura Moodle o bé allà on li ho indiqui el professorat. També cal portar una llibreta tipus Miquelrius, Abacus o Oxford amb els fulls cosits, on cada estudiant anotarà les observacions fetes. Per a la realització de les pràctiques l'alumnat treballarà en parella i sota la supervisió del professorat. A l’inici i/o durant cada sessió el professor o la professora farà breus explicacions teòriques del contingut de les pràctiques i de les experiències que han de fer els alumnes, així com de les mesures de seguretat específiques i del tractament dels diferents residus químics i biològics generats.
Per aconseguir un bon rendiment i adquirir les competències corresponents a aquesta assignatura és imprescindible que l’estudiant faci una lectura comprensiva del manual de l’assignatura i que es familiaritzi amb les pràctiques que durà a terme cada sessió i amb la metodologia que haurà d’aplicar en cada cas.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
---|---|---|---|---|
Avaluació del mòdul 1, microbiologia Industrial: presentació oral i participació | 20 % | 1 | 0,04 | CM17, CM18, SM25 |
Avaluació del mòdul 1, microbiologia industrial: examen tipus test | 20 % | 0,5 | 0,02 | KM25, KM26, SM26, SM27, SM28 |
Avaluació del mòdul 2, microbiologia ambiental: examen tipus test | 30 % | 0,5 | 0,02 | KM25, KM26, SM25, SM26 |
Avaluació del mòdul 2, microbiologia ambiental: lliurament de l'informe | 3,3 % | 0 | 0 | CM17, CM18, SM25 |
Avaluació del mòdul 2, microbiologia ambiental: presentació oral i participació | 6,7 % | 1 | 0,04 | KM25, KM26, SM26, SM27, SM28 |
Lliurament de la llibreta de laboratori | 20 % | 0 | 0 | CM17, CM18, SM25 |
L'avaluació de l'assignatura es fa per a cada mòdul i és continuada. El pes de l'avaluació sobre la qualificació final de l'assignatura de cada mòdul és d'un 50 % per al mòdul 1 d'un 50 % per al mòdul 2. Per poder superar l'assignatura caldrà obtenir una nota igual o superior a 5 en cadascun dels mòduls pràctics per separat.
L'avaluació de cada mòdul es farà de la manera següent:
Mòdul 1: Microbiologia industrial
Avaluació continuada del treball en grup
Exposició oral, discussió de resultats de les pràctiques i participació en les pràctiques (20 %)
Avaluació individual dels continguts
Seguiment diari de la llibreta i de treball de laboratori (10 %)
Qüestionari individual amb preguntes de tipus test* (20 %)
*El qüestionari individual es pot fer durant qualsevol moment de les sessions de pràctiques i pot haver-hi més d'un qüestionari
Mòdul 2: Microbiologia ambiental
Avaluació continuada del treball en grup
Lliurament d’un informe final sobre bioreactors (3,3 %)
Exposició oral i discussió de resultats de les pràctiques i participació en les pràctiques (6,7 %)
Avaluació individual dels continguts
Seguiment diari de la llibreta de laboratori (10 %)
Qüestionari individual amb preguntes de tipus test (30 %)
En cada mòdul s’avaluarà l’actitud de l’estudiant al laboratori, la puntualitat, la utilització d’equipament del laboratori (bata i ulleres de protecció), el compliment de les normatives de seguretat i bioseguretat i la comprensió i el seguiment del manual de l’assignatura. Aquesta avaluació no comporta un augment de la nota, però pot significar la reducció de fins a un 20 % de la qualificació final obtinguda a cada mòdul.
Atès que l’assistència a les activitats programades en aquesta assignatura és obligatòria, l’absència a alguna de les sessions ha de ser justificada i no pot ser superior al 20 %. En qualsevol cas, aquest 20 % no es pot acumular en un únic mòdul. L'absència màxima a cada mòdul és del 10 %. En cas que se superi aquest valor l’assignatura es qualificarà amb un no avaluable.
Els estudiants que no superin les avaluacions dels diferents mòduls de l’assignatura els poden recuperar en la data programada al final del semestre (prova de recuperació) tot responent un qüestionari associat al mòdul no superat anteriorment. En aquesta prova es pot recuperar per separat l'avaluació de l'examen tipus test de cada mòdul (20 % i 30 %, respectivament). Les altres activitats no tenen recuperació.
L'alumnat que no obtingui la qualificació mínima requerida per superar cada un dels mòduls del laboratori integrat, no aprovarà l’assignatura. En aquest cas, la qualificació final màxima de l’assignatura serà un 4.
Com que aquesta assignatura està diferenciada en mòduls, a partir de la segona matrícula, l'alumnat repetidor tan sols s’ha d’avaluar dels mòduls concrets que no han estat superats.
Avaluació única
L’alumnat que s’aculli a l’avaluació única ha de fer les pràctiques de laboratori en sessions presencials ja que són activitats docents d’assistència obligatòria.
L'avaluació única consisteix en un examen final que pot contenir preguntes tipus test, preguntes curtes i problemes a desenvolupar sobre els continguts teòrics i pràctics de l'assignatura. La nota obtinguda en aquesta prova de síntesi és el 50 % de la nota final de l’assignatura. Aquesta prova d’avaluació única es farà coincidint amb la mateixa data fixada en calendari per a la darrera prova d’avaluació continuada. S'aplicarà el mateix criteri per aprovar l'assignatura que per a l’avaluació continuada.
L’avaluació continuada del treball individual i en grup, el seguiment diari de la llibreta, l’exposició oral i discussió dels resultats i l’informe de la segona part serà el 50 % restant i es faran en les mateixes dates fixades per a l’avaluació continuada.
S’aplicarà el mateix sistema de recuperació que per l’avaluació continuada. La revisió de la qualificació final segueix el mateix procediment que per a l’avaluació continuada.
La bibliografia i els enllaços web s’indiquen en els protocols de pràctiques.
La programació de l'assignatura es pot consultar a l’espai docent de la coordinació del grau en Microbiologia.
Microbiologia industrial
R.S. Burlage, R. Atlas, D. Stahl, G. Geesey and G. Sayler, (1998). Techniques in Microbial Ecology. New York, NY. Oxford University Press.
L-M. Prescott (2002). Microbiology. Capter 42: Industrial Microbiology and biotechnology, 5th Edition, New York, NY. The McGraw−Hill Companies.
M. Rabbani, H.M. Sadeghi, F. Moazen, M. Rahimi and G. Salehi. (2011). Cloning and Expression of Randomly Mutated Bacillus subtilis α-Amylase Genes in HB101. Biotechnology Research International 2011:305956. doi:10.4061/2011/305956
R.C. Cadwell andG.F. Joyce. (1994). Mutagenic PCR. Genome Res. 3: S136-S140.
M.J. Waites, N.L. Morgan, J.S. Rockey and G. Higton (2001) Industrial Microbiology: an introduction. London, UK. Blackwell Science Ltd.
M.R. Ladisch, N.S., Mosier, (2009) Modern Biotechnology. John Wiley & Sons, Inc. https://doi.org/10.1002/9780470473412
Protocol per a l'activitat amb alfa amilasa: http://www.worthington-biochem.com/aa/assay.html
Preparació d'un tampó de fosfats: http://openwetware.org/wiki/Phosphate_buffer
Microbiologia ambiental
1. Gestió de residus
Martin Alexander (1999) Biodegradation and Bioremediation. 2nd Edition. Cornell University, Ithaca, New York, U.S.A. AcademicPress.
Ajay Singh, Ramesh C. Kuhad, Owen P. Ward. (2009) Advances in applied bioremediation. Berlin, Heidelberg. Springer-Verlag. https://dx.doi.org/10.1007/978-3-540-89621-0
Ralph, M. and Ji-Dong, G. (eds) (2010) Environmental Microbiology. 2nd Edition. Wiley-Blackwell. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/book/10.1002/9780470495117
Yates, M. V. et al. (eds) (2016) Manual of Environmental Microbiology. 4th Edition. ASM Press. doi: 10.1128/9781555818821.
2. Control de la contaminació ambiental
Wen-TsoLiu, Janet K. Caister (2010) Microbiology. Norfolk, UK. Academic Press.
Harley−Prescott. (2002) Laboratory exercises in microbiology (5th Edition). Boston, Mass. The McGraw-Hill companies.
Delort, A.-M. and Amato, P. (eds) (2017) Microbiology of aerosols. Wiley Blackwell. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/book/10.1002/9781119132318
Mohee, R. and Mudhoo, A. (eds) (2012) Bioremediation and Sustainability: Research and Applications. Wiley-Blackwell. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/book/10.1002/9781118371220
3. Control biològic
H.J. Benson, (2001) Microbiological applications. Laboratory manual in general microbiology (8th edition). Boston, Mass. The McGraw-Hill companies.
B. Prapagdee, C. Kuekulvongand S. Mongkolsuk (2008). Antifungal Potential of Extracellular Metabolites Produced by Streptomyces hygroscopicus against Phytopathogenic Fungi. International Journal of Biological Sciences 4:330-337.
Ghannoum, M. et al. (eds) (2015) Microbial Biofilms. Second Edi. ASM Press. doi: 10.1128/9781555817466.
Microbiologia general
Martín A., Béjar V., Gutierrez J.C., Llagostera M. y Quesada E. 2019. Microbiología Esencial. 1ª edición. Editorial Médica Panamericana. https://www.medicapanamericana.com/VisorEbookV2/Ebook/9788491102427
No hi ha previst un programari específic
Nom | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
---|---|---|---|---|
(PAUL) Pràctiques d'aula | 731 | Català/Espanyol | segon quadrimestre | matí-mixt |
(PLAB) Pràctiques de laboratori | 731 | Català/Espanyol | segon quadrimestre | matí-mixt |
(PLAB) Pràctiques de laboratori | 732 | Català/Espanyol | segon quadrimestre | matí-mixt |
(PLAB) Pràctiques de laboratori | 733 | Català/Espanyol | segon quadrimestre | matí-mixt |