Ecologia microbiana
Codi: 100825 Crèdits: 4| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| 2500251 Biologia ambiental | OB | 3 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Maria Ramos Martinez Alonso
- Correu electrònic:
- maira.martinez@uab.cat
Equip docent
- Olga Sanchez Martinez
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
Tot i que no hi ha cap prerequisit oficial, s'aconsella a l'alumnat revisar els conceptes que es refereixen al món microbià, estudiats prèviament.
Per poder cursar aquesta assignatura cal que l’alumnat hagi superat la prova de Seguretat i de Bioseguretat que trobarà en el corresponent espai docent de l'Aula Moodle. Cal presentar imprès, el primer dia de classe, els documents pdf generats al superar els tests. També, cal ser coneixedor i acceptar les normes de funcionament dels laboratoris de la Facultat de Biociències. A més a més, és imprescindible que l’estudiantat segueixi la normativa de treball que indiqui el professorat. Per raons de seguretat, si no s’han superat els dos tests, o bé no es porta bata i ulleres de seguretat no es permetrà l’accés al laboratori.
Objectius
És una assignatura obligatòria, nuclear del grau de Biologia Ambiental, que introdueix l’alumnat en els principis i terminologia, així com en els mètodes d'estudi de l’Ecologia Microbiana.
Els objectius de l'assignatura són:
1. Conèixer els conceptes bàsics i els mètodes d'estudi de l'Ecologia Microbiana.
2. Conèixer els microorganismes en els seus hàbitats naturals i els factors ambientals que afecten la seva distribució.
3. Reconèixer les principals relacions que estableixen els microorganismes entre ells i amb altres éssers vius, com les plantes i els animals.
4. Conèixer el paper dels microorganismes en els cicles biogeoquímics.
Competències
- Comprendre les bases de la regulació de les funcions vitals dels organismes a través de factors interns i externs i identificar mecanismes d'adaptació al medi.
- Comunicar-se eficaçment oralment i per escrit.
- Conèixer una llengua estrangera (anglès).
- Identificar i interpretar la diversitat d'espècies en el medi.
- Integrar els coneixements dels diferents nivells organitzatius dels organismes en el seu funcionament.
- Mostrejar, caracteritzar i manipular poblacions i comunitats.
Resultats d'aprenentatge
- Aïllar, conrear i identificar al laboratori microorganismes, principalment bacterians.
- Comunicar-se eficaçment oralment i per escrit.
- Conèixer una llengua estrangera (anglès).
- Interpretar el paper dels microorganismes, principalment bacterians, en el funcionament dels sistemes biològics.
- Interpretar la distribució, els requeriments i les interaccions biològiques en el medi dels microorganismes, principalment bacterians.
- Reconèixer els processos funcionals que determinen l'adaptació dels microorganismes, principalment bacterians, al medi.
- Reconèixer les bases bioquímiques i la seva relació amb els processos metabòlics que determinen el funcionament dels microorganismes, principalment bacterians.
Continguts
TEORIA
I. INTRODUCCIÓ I MÈTODES
1. Ecologia Microbiana: concepte i desenvolupament històric
Desenvolupament històric. L’Ecologia Microbiana a l’actualitat. Conceptes d’Ecologia Microbiana.
2. Mètodes d’estudi de l’Ecologia Microbiana (I)
Característiques i objectius del mostreig en Ecología Microbiana. Aparells de mostreig en diferents hàbitats. Preservació de mostres.
3. Mètodes d’estudi (II)
Quantificació de microorganismes en l’ambient natural. Estimació de la biomassa. Estimació de la biodiversitat microbiana amb tècniques moleculars.
4. Mètodes d’estudi (III)
Detecció i mesura de l’activitat microbiana.
II. INTERACCIONS ENTRE POBLACIONS
5. Interaccions entre poblacions microbianes
Interaccions dins d'una mateixa població. Transmissió de senyals químiques entre microorganismes:quòrum sensing. Neutralisme. Interaccions positives: comensalisme, sinergisme i mutualisme. Interaccions negatives: competició, amensalisme, predació i parasitisme.
6. Interaccions entre plantes i microorganismes
Rizosfera. Micorrizes, Fixació de nitrogen en els nòduls radicals. Fil·losfera.
7. Interaccions entre microorganismes i animals
Contribució dels microorganismes a la nutrició animal. Depredació d’animals per fongs. Altres relacions simbiòtiques.
III. ELS MICROORGANISMES EN ELS SEUS HÀBITATS NATURALS
8.Comunitats i ecosistemes microbians
Estructura i dinàmica de les comunitats microbianes. Efecte dels factors ambientals sobre la distribució dels microorganismes.
9. Ambients marins i d’aigua dolça
L'aigua com a hàbitat microbià. Ecosistemes lòtics i lèntics. Ecosistemes marins costaners. Mar obert.
10. Ecosistemes terrestres
Microbiomes edàfics: el sòl i la rizosfera. Microbiologia dels sediments.
11. Ambients extrems
Què és un ambient extrem? Exemples: Fonts hidrotermals terrestres i dels sediments marins. Oceà profund. Deserts càlids i freds. Ambients acídics i alcalins. El subsòl.
12. Els microorganismes en els cicles dels nutrients
Cicle del carboni: transferència del carboni a través de les xarxes tròfiques. Cicle del nitrogen, del sofre i altres elements. Interrelacions entre els cicles.
PRÀCTIQUES DE LABORATORI
Caracterització de models experimentals:
Pràctica 1. Observació macro i microscòpica
Pràctica 2. Determinació de paràmetres físics i químics
Pràctica 3. Recompte de microorganismes
Pràctica 4. Determinació de la biomassa total
Pràctica 5. Caracterització metabòlica de l'ecosistema: activitat enzimàtica
Pràctica 6. Caracterització metabòlica de l'ecosistema: utilització de fonts de carboni
Pràctica 7. El cicle del nitrogen
Pràctica 8. Enriquiment i aïllament de diferents grups fisiològics microbians
Pràctica 9. Determinació de la temperatura òptima de creixement d'un dels bacteris aïllats
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Classes teoria | 24 | 0,96 | 2, 3, 4, 5, 6, 7 |
| Pràctiques de laboratori | 12 | 0,48 | 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 |
| Tipus: Supervisades | |||
| Tutories individuals/en grup | 2 | 0,08 | 4, 5, 6, 7 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Estudi | 35 | 1,4 | 3, 4, 5, 6, 7 |
| Lectura de textos | 7 | 0,28 | 3 |
| Preparació i redacció de treballs | 10 | 0,4 | 2, 3, 4, 5, 6, 7 |
| Recerca bibliogràfica | 5 | 0,2 | 3 |
L'assignatura d'Ecologia Microbiana consta de dos mòduls, els quals s'han programat de manera integrada de forma que l'estudiantat haurà de relacionar al llarg de tot el curs el contingut i les activitats programades per tal d'assolir les competències indicades en aquesta guia.
Els dos mòduls són els següents:
Classes teòriques. Dins d'aquest mòdul, les classes magistrals o expositives representen la principal activitat a realitzar a l’aula i permeten transmetre conceptes bàsics a un gran nombre d’alumnat en relativament poc temps. Es complementaran amb presentacions tipus Power Point i material didàctic divers que serà lliurat a l'alumnat a l’inici del curs.
Classes pràctiques de laboratori. Aquesta assignatura s’impartirà en grups reduïts amb un màxim de 24 alumnes per sessió de laboratori. Cada alumne/a està assignat a un grup de pràctiques i no podrà canviar-se de grup sense el permís del responsable de l'assignatura.
L’assistència a totes les pràctiques és obligatòria i cal ser molt puntual. Un cop el professorat hagi començat l'explicació de la pràctica, no es permetrà l'entrada de cap més alumne/a a l'aula. Si un alumne/a, per causa justificada, no ha pogut assistir a una sessió de pràctiques, haurà de posar-se en contacte amb el professor responsable de l'assignatura i presentar-li el justificant corresponent. En aquest cas se li assignarà un nou dia per poder recuperar la pràctica. En cas que la pràctica ja s'hagi deixat d'impartir i l'alumnat no la pugui recuperar, no se li comptarà com a falta d'assistència.
Al començament del curs l'alumnat rebrà un Manual amb el treball pràctic que haurà de desenvolupar durant el curs. Els objectius d'aquestes activitats són: a) facilitar la comprensió dels coneixements exposats en les classes teòriques, b) adquirir destresa manual, c) interpretar resultats i d) integrar els coneixements teòrics amb els pràctics.
És obligatori l’ús de bata en totes les sessions de pràctiques que es realitzin en el laboratori i també de les ulleres de protecció en les sessions que ho indiqui el professorat. A més, cada alumne/a haurà de portar el Manual de Pràctiques corresponent i una llibreta per anotar els resultats del treball.
Informació addicional:
Per tal de donar suport a les activitats formatives indicades anteriorment, a petició de l'estudiantat es podran realitzar tutories individuals al despatx de les professores Olga Sánchez (C3-335) i Maira Martínez-Alonso (C3-329).
L'alumnat disposarà en el Campus Virtual de l'assignatura de tota la documentació que facilitarà el professorat per un bon seguiment de la mateixa. També podran consultar l'espai docent de la Coordinació de Grau per obtenir informació actualitzada referent al mateix.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Avaluació de pràctiques de laboratori | 35 | 1 | 0,04 | 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 |
| Avaluació de teoria, primer parcial | 32,5 | 2 | 0,08 | 2, 4, 5, 6, 7 |
| Avaluació de teoria, segon parcial | 32,5 | 2 | 0,08 | 2, 4, 5, 6, 7 |
L'avaluació de l'assignatura serà individual i continuada a través de les següents proves:
Mòdul d'avaluació de les classes teòriques (65% de la nota global): Al llarg del curs es programaran dues proves parcials escrites d'avaluació d'aquest mòdul. Cadascuna de les proves tindrà un pes del 50% de la nota del mòdul i caldrà obtenir una qualificació igual o superior a 5 per promitjar entre elles. Cada prova constarà de preguntes tipus test d'elecció mútiple, que permetran valorar una gran part dels continguts, i/o preguntes de resposta curta dirigides a valorar si s’han assolit els objectius conceptuals clau.
Mòdul d'avaluació de les classes pràctiques de laboratori (35% de la nota global): L'avaluació inclourà una prova escrita amb preguntes tipus test d'elecció mútiple i problemes (20%), l'exposició oral dels resultats de les pràctiques (5%) i el seguiment individual diari de les habilitats pràctiques adquirides per l'alumnat (10%).
Consideracions finals:
Per superar l'assignatura s'ha d'obtenir una qualificació de 5 o superior en cada mòdul. L'alumnat que no superi algun dels dos mòduls, haurà de presentar-se a un examen de recuperació en la data programada per l'avaluació final de l'assignatura, on entrarà tot el temari de teoria i/o la prova escrita de pràctiques. El seguiment individual de les habilitats adquirides no es podrà recuperar.
Per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació totalde l'assignatura. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de No Avaluable quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final
La presentació de l'estudiantat a pujar nota comporta la renúncia a la qualificació obtinguda per parcials i haurà de realitzar l'examen de tots els continguts de la matèria el dia fixat per l'examen de recuperació.
A partir de la segona matrícula, l'alumnat repetidor no haurà de dur a terme les activitats docents, ni les avaluacions d'aquelles competències superades, corresponents al mòdul de pràctiques. És a dir, es guardarà la nota obtinguda al mòdul de pràctiques, sempre i quan hagi estat superat.
Avaluació única
Aquesta assignatura preveu el sistema d'avaluació única que consisteix en una única prova de síntesi en la que s’avaluaran els continguts de tot el programa de teoria de l'assignatura. La prova constarà de preguntes de resposta curta dirigides a valorar si s’han assolit els objectius conceptuals clau de l’assignatura i preguntes tipus test d'elecció múltiple i/o de cert/fals, que permetran valorar una gran part dels continguts. La nota obtinguda en aquesta prova de síntesi suposarà el 65% de la nota final de l’assignatura i haurà de ser igual o superior a 5 per fer mitjana amb el mòdul de pràctiques. L’avaluació única es farà el mateix dia que el 2n parcial de l’assignatura.
L’avaluació del mòdul de pràctiques seguirà el mateix procés que l’avaluació continua. La nota obtinguda suposarà el 35 % de la nota final de l’assignatura. El mòdul de pràctiques és d’assistència obligatòria a totes les sessions. És requisit tenir aprovat el mòdul de pràctiques (nota igual o superior a 5) per a poder superar l'assignatura.
Bibliografia
Llibres de text:
Atlas RM, Bartha R. 2002. Ecología microbiana y microbiologia ambiental. 4a ed., Pearson Educación SA.
Kirchman DL. 2018. Processes in microbial ecology. 2nd ed. Oxford University Press. Recurs electrònic.
Madigan MT, Martinko JM, Bender KS, Buckley DH, Stahl DA. 2015. Brock Biología de los Microorganismos. 14a ed. Pearson Education. Recurs electrònic.
Madigan MT, Bender KS, Buckley DH, Sattley WM, Stahl DA. 2021. Brock Biology of Microorganisms. 16th ed. Pearson SA.
Martín A, Béjar V, Gutiérrez JC, Llagostera M, Quesada E. 2019. Microbiología Esencial. 1a ed. Editorial Médica Panamericana. Recurs electrònic.
Willey J, Sherwood LM, Woolverton CJ. 2009. Microbiología de Prescott, Harley y Klein. 7a ed. MacGraw-Hill.
Willey JM, Sherwood LM, Woolverton CJ. 2020. Prescott's Microbiology. 11th ed. MacGraw-Hill.
Willey JM, Sandman KM. 2021. Prescott's Principles of Microbiology. 2nd ed. MacGraw-Hill. Recurs electrònic.
En aquest enllaç, es pot trobar una infografia que ha preparat el Servei de Biblioteques per facilitar la localització de llibres electrònics: https://bibcercador.uab.cat/discovery/search?search_scope=CourseReserves&vid=34CSUC_UAB:VU1&query=course_code,contains,100825
Programari
No es necessita un programari específic en aquesta assignatura.
Llista d'idiomes
| Nom | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 231 | Català | primer quadrimestre | tarda |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 232 | Català | primer quadrimestre | tarda |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 233 | Català | primer quadrimestre | tarda |
| (TE) Teoria | 23 | Català | primer quadrimestre | matí-mixt |