Bioquímica
Codi: 100812 Crèdits: 6| Titulació | Tipus | Curs |
|---|---|---|
| 2500251 Biologia ambiental | FB | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- David Reverter Cendros
- Correu electrònic:
- david.reverter@uab.cat
Idiomes dels grups
Podeu consultar aquesta informació al final del document.
Prerequisits
No hi ha prerequisits oficials. Tot i això, se suposa que l’estudiant ha adquirit els coneixements bàsics impartits a les assignatures de Biologia i de Química del batxillerat.
Objectius
A l’assignatura Bioquímica s’estudien en una primera part les característiques estructurals i funcionals de les biomolècules des d’un punt de vista bàsic i general, fent èmfasi en les proteïnes, i especialment en els enzims. En una segona part els conceptes s’aplicaran de manera dinàmica per entendre la bioenergètica, la biosenyalització i les rutes principals del metabolisme. L’objectiu general de l’assignatura és proporcionar els fonaments dels aspectes i conceptes moleculars i metabòlics necessaris per al seguiment de diferents matèries del Grau de Biologia Ambiental.
Objectius concrets de l’assignatura:
- Comprendre els trets estructurals fonamentals de les molècules biològiques, sabent-ne extreure conclusions sobre la seva estabilitat, la seva funcionalitat i la seva capacitat per la replicació d’estructures.
- Comprendre els conceptes de cinètica de l’acció enzimàtica en el context de l’estudi de les reaccions biològiques i la seva regulació.
- Descriure els mecanismes generals mitjançant els quals els éssers vius obtenen i transformen l’energia de l’entorn.
- Conèixer els mecanismes moleculars principals de transducció de senyals.
- Descriure les rutes principals del metabolisme intermediari de glúcids, lípids i compostos nitrogenats, la seva regulació i coordinació.
- Saber com aplicar els coneixements estudiats per a resoldre problemes qualitatius i quantitatius.
Competències
- Comprendre les bases de la regulació de les funcions vitals dels organismes a través de factors interns i externs i identificar mecanismes d'adaptació al medi.
- Demostrar coneixements bàsics de matemàtiques, física i química
- Desenvolupar bioassaigs i aplicar processos biotecnològics.
- Desenvolupar l'aprenentatge autònom.
- Obtener información, diseñar experimentos e interpretar los resultados
- Raonar críticament.
- Resoldre problemes.
Resultats d'aprenentatge
- Adquirir una base sòlida de les principals vies metabòliques.
- Comprendre el llenguatge bioquímic bàsic.
- Conèixer les funcions biològiques bàsiques de les biomolècules.
- Desenvolupar l'aprenentatge autònom.
- Dominar els conceptes de la catàlisi enzimàtica i la bioenergètica.
- Identificar les propietats fisicoquímiques de les biomolècules.
- Obtenir informació, dissenyar experiments i interpretar-ne els resultats.
- Raonar críticament.
- Reconèixer l'estructura química de les biomolècules.
- Reconèixer les bases moleculars de les principals estructures i funcions biològiques.
- Resoldre problemes.
- Saber resoldre problemes d'equilibri àcid-base, cinètica enzimàtica i bioenergètica.
Continguts
TEORIA
TEMA 1. ELEMENTS, MOLÈCULES I ENTORN FÍSIC DELS ÉSSERS VIUS.
La lògica química dels processos biològics. Elements químics presents als éssers vius. Biomolècules. Nivells d'organització estructural de les biomolècules. Importància biològica de l’aigua. Interaccions no covalents en medi aquós. Ionització de l'aigua, equilibri iònic i sistemes amortidors.
TEMA 2. PROTEÏNES: FUNCIONS I ESTRUCTURA.
Tipus de proteïnes i funcions de les mateixes. Estructura i propietats dels aminoàcids. Classificació dels aminoàcids. Pèptids i enllaç peptídic. Composició i seqüència dels aminoàcids en les proteïnes. Nivells d’estructuració de les proteïnes. Descripció de l’hèlix alfa i la fulla plegada beta. Proteïnes fibroses. Proteïnes globulars. Estructura quaternària. Prions.
TEMA 3. GLÚCIDS
Tipus de glúcids i funcions dels mateixos. Descripció i propietats dels monosacàrids. Enllaç glicosídic. Oligosacàrids. Polisacàrids. Glicoproteïnes i glicolípids.
TEMA 4. ÀCIDS NUCLEICS
Composició, classes i funcions delsàcids nucleics. Estructura primària i estructures d’ordre superior dels àcids nucleics. Cromatina i organització dels cromosomes. Amplificació i seqüenciació d’àcids nucleics.
TEMA 5. FUNCIO I EVOLUCIÓ DE PROTEÏNES: PROTEÍNES TRANSPORTADORES D’OXIGEN
Emmagatzematge d’oxigen: mioglobina. Transport d’oxigen: hemoglobina. Al·losterisme i cooperativitat de l’hemoglobina. Exemples d’evolució proteica. Diferents formes d’hemoglobina: adaptacions fisiològiques i patologies associades.
TEMA 6. AÏLLAMENT I CARACTERITZACIÓ DE LES MACROMOLÈCULES
Mètodes de separació: centrifugació, cromatografia i electroforesi. Mètodes espectroscòpics i les seves aplicacions. Determinació d’estructures tridimensionals. Mètodes immunològics.
TEMA 7. ENZIMS, CINÈTICA ENZIMÀTICA I REGULACIÓ.
Enzims: naturalesa i funció. Classificació i nomenclatura dels enzims. Efectes dels catalitzadors en les reaccions químiques. Mecanismes enzimàtics. Velocitat inicial. Cinètica enzimàtica. Cofactors enzimàtics. Inhibició enzimàtica. Regulació de l’activitat enzimàtica: al·losterisme, modificació covalent i canvis en la concentració d’enzim. Aplicacions biomèdiques, biotecnològiques i mediambientals.
TEMA 8. LÍPIDS I MEMBRANES BIOLÒGIQUES.
Tipus de lípids i funcions. Estructura i funció de les lipoproteïnes. Membranes biològiques.
TEMA 9. INTRODUCCIÓ AL METABOLISME.
Metabolisme: concepte, organització i tipus. Reaccions bioquímiques i termodinàmica: energia lliure als processos biològics. Paper de l’ATP i altres compostos fosforilats. Reaccions biològiques d’oxidació-reducció i paper dels transportadors d’electrons. Regulació dels processos metabòlics.
TEMA 10. BIOSENYALITZACIÓ.
Senyals químics extracel.lulars: hormones, neurotransmissors, òxid nítric i factors de creixement. Propietats dels mecanismes de transducció de senyals. Sistemes principals de transducció de senyals: receptors de membrana i intracel·lulars.
TEMA 11. METABOLISME DE GLÚCIDS.
Degradació de la glucosa: glicòlisi i via de les pentoses fosfat. Fermentacions. Gluconeogènesi. Síntesi i degradació de glicogen.Utilització d’altres glúcids.
TEMA 12. RUTES CENTRALS DEL METABOLISME OXIDATIU I FOSFORILACIÓ OXIDATIVA.
Producció d’acetil-CoA. Cicle de l’àcid cítric. Rendiment energètic i regulació. Reaccions anapleròtiques. Cicle del glioxilat. Cadena de transport electrònic mitocondrial i fosforilació oxidativa. Control respiratori. Agents desacoblants.
TEMA 13. FOTOSÍNTESI.
Procés bàsic de la fotosíntesi. Pigments fotosintètics. Absorció de l’energia de la llum. Transport electrònic i fotofosforilació. Assimilació del diòxid de carboni i biosíntesi fotosintètica de glúcids (cicle de Calvin). Regulació de la fotosíntesi. Fotorespiració. Metabolisme de plantes C4 i crasses.
TEMA 14. METABOLISME DE LIPIDS
Metabolisme d’àcids grassos. Regulació del metabolisme d’àcids grassos. Cetogènesi. Metabolisme de colesterol i lipoproteïnes.
TEMA 15. METABOLISME DELS COMPOSTOS NITROGENATS
Cicle del nitrogen. Mecanismes bàsics de la degradació d’aminoàcids. Eliminació de l’amoníac i cicle de la urea. Biosíntesi d’aminoàcids. Degradació d’àcids nucleics i nucleòtids. Síntesi i recuperació de nucleòtids.
PROBLEMES
El contingut d’aquest apartat, que es lliurarà en forma de dossier al començament del semestre, consisteix en una quantitat determinada d’enunciats de problemes relacionats amb els temes desenvolupats a Teoria. Les característiques pròpies de les diverses parts del temari de Teoria fan que els enunciats dels problemes es concentrin en alguns aspectes determinats que són: equilibri químic i sistemes amortidors, mètodes de purificació i d’anàlisi de macromolècules, cinètica enzimàtica i bioenergètica i energia lliure i constant d’equilibri.
PRÀCTIQUES DE LABORATORI
Es faran tres sessions de laboratori de quatre hores cadascuna.
L'assistència a les sessions pràctiques és obligatòria. L'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan l'absència sigui superior al 20% de les sessions programades.
Activitats formatives i Metodologia
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Classes de Problemes | 9 | 0,36 | 4, 5, 8, 11 |
| Classes de Teoria | 31 | 1,24 | 1, 4, 3, 5, 8, 10 |
| Pràctiques de laboratori | 12 | 0,48 | 3, 5, 8, 10 |
| Tipus: Supervisades | |||
| Tutories | 3 | 0,12 | 4, 3, 8 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Estudi | 86,5 | 3,46 | 1, 4, 3, 5, 8, 10, 11 |
Les activitats formatives estan repartides en tres apartats: classes de teoria, classes de problemes i pràctiques de laboratori, cadascuna d’elles amb la seva metodologia específica.
Classes de teoria
El professor/a explicarà el contingut del temari amb el suport de material audiovisual que estarà a disposició dels estudiants al Campus Virtual (Moddle) de l’assignatura amb antelació a l’inici de cadascun dels temes del curs. Aquestes sessions expositives constituiran la part més important de l’apartat de teoria. És recomanable que els estudiants disposin del material publicat al Moddle en forma impresa per tal de poder seguir les classes amb més comoditat.
Sota el guiatge del professor i mitjançant comunicació a través del Moddle, els coneixements d’algunes parts escollides del temari hauran de ser cercats i estudiats mitjançant aprenentatge autònom per part dels estudiants.
Classes de problemes
El grup es dividirà en dos subgrups de 30 estudiants aproximadament, les llistes dels quals es faran públiques a començaments de curs. Els estudiants assistiran a les sessions programades pel seu grup.
A començaments de semestre es lliurarà a través del Campus Virtual un dossier d’enunciats de problemes de l’assignatura que s’aniran resolent al llarg de les sessions. En aquestes sessions repartides al llarg del semestre, el professor de problemes exposarà els principis experimentals i de càlcul necessaris per treballar els problemes, explicant les pautes per la seva resolució i reforçant al mateix temps els coneixements de diferents parts de lamatèria de les classes de teoria.
Pràctiques de laboratori
El grup es subdividirà en tres subgrups, les llistes dels quals seran anunciades amb antelació i que seran els mateixos per totes les assignatures del semestre. Cal comparèixer a les pràctiques amb bata de laboratori, el protocol de pràctiques (disponible al Campus Virtual) imprès i prèviament llegit i una llibreta per anotar les observacions realitzades i les dades obtingudes.
En els dies establerts al calendari, els estudiants seran convocats al laboratori de Bioquímica per a dur a terme experiències bàsiques en la determinació de propietats i en l’anàlisi de biomolècules. Les pràctiques, així com la seva avaluació, es duran a terme en grups de dues persones. Al final de cada sessió s’haurà d’entregar un qüestionari amb els resultats de l’experiment i les contestacions a les preguntes plantejades. L’assistència a les pràctiques és obligatòria, excepte en els casos en què hi hagi una causa justificada documentalment.
Material disponible al Moddle de l’assignatura
· Guia docent
· Presentacions utilitzades pel professor a les classes de teoria
· Dossier de les classes de problemes
· Protocols de les classes pràctiques
· Calendari de les activitats docents (classes d’aula, classes de laboratori, tutories, avaluacions...)
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Avaluació
Activitats d'avaluació continuada
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Examens de Problemes | 20% | 2,5 | 0,1 | 4, 6, 3, 5, 8, 9, 12, 11, 2 |
| Examens de Teoria | 70% | 4,5 | 0,18 | 1, 4, 6, 3, 5, 8, 9, 10, 2 |
| Questionaris de Pràctiques | 10% | 1,5 | 0,06 | 3, 5, 7, 8, 10 |
L’avaluació de l’assignatura es durà a terme mitjançant una avaluació continuada que consistirà en dos proves, corresponents cadascuna a aproximadament la meitat del temari de teoria i de problemes. Cada prova tindrà dues parts. La primera part consistirà en varies preguntes tipus test i també podrà incloure preguntes curtes. En la segona part, l’alumne haurà de resoldre un o dos problemes. Aquells alumnes que no hagin superat les proves parcials hauran realitzar una prova final per tal de recuperar aquestes proves parcials. La prova final tindrà dues parts. En la primera part l’alumne es trobarà un examen amb preguntes tipus test, que també podrà incloure preguntes curtes, per cada parcial a recuperar. En la segona part, l’alumne haurà de resoldre dos problemes, un per cada parcial a recuperar. La prova final també estarà oberta a qualsevol estudiant que, havent superat l’avaluació continuada, desitgi millorar la nota obtinguda en l'avaluació continuada. En aquest cas l'alumne renuncia a la nota anterior.
Cada una de les pràctiques de laboratori serà avaluada just després de la seva realització mitjançant la contestació d’un qüestionari relacionat amb la pràctica realitzada.
La nota final obtinguda es calcularà de la següent manera:
a) Alumnes que han superat l’assignatura durant l'avaluació continuada:
– 70% del promig de la primera part de cada prova parcial (35% cada prova parcial)
– 20% del promig de la segona part de cada prova parcial (10% cada prova parcial)
– 10% del promig de les pràctiques.
Només promitjaran aquelles qualificacions de les proves parcials que siguin iguals o superiors a quatre.
b) Alumnes que es presentin a l’examen final:
– 70% de la primera part de la prova final (35% cada prova parcial)
– 20% de la segona part de la prova final (10% cada prova parcial)
– 10% del promig de les pràctiques
Per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final.
L'assistència a les sessions pràctiques és obligatòria. L'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan l'absència sigui superior al 20% de les sessions programades.
Avaluació Única:
L’alumnat que s’aculli a l’avaluació única ha de fer les pràctiques de laboratori (PLAB) en sessions presencials i és requisit tenir-les aprovades i tindran un pes del 10%.
L’avaluació única consisteix en una prova de síntesi única amb preguntes de tipus test (pot incloure preguntes curtes) sobre els continguts de tot el programa de teoria (70%); així com 2 problemes per ressoldre (20%).
La prova d’avaluació única es farà coincidint amb la mateixa data fixada en calendari per a la darrera prova d’avaluació continuada i s’aplicarà el mateix sistema de recuperació que per l’avaluació continuada.
Bibliografia
Bibliografia bàsica (per ordre alfabètic):
TEORIA
Berg, J.M., Tymoczko, J.L., Stryer L. "Bioquímica. Curso básico" (2014) Ed. Reverté. Correspon a la traducció de la 2a. Ed. en llengua anglesa.
Feduchi, E. i altres. "Bioquímica. Conceptos esenciales" (2011) 1a. Ed. Panamericana.
Mathews, C.K., van Holde K.E. i Ahern, K. G. “Bioquímica” (2002) 3a. Ed. Addison/Wesley.
McKee, T i McKee, J.R. “Bioquímica. Las bases moleculares de la vida” (2011).4a. Ed. McGraw-Hill-Interamericana.
Nelson, D.L. i Cox, M.M. “Lehninger Principles of Biochemistry” (2008) 5th Ed. W.H. Freeman & Co. Traduïda la 5a. Ed: “Principios de Bioquímica” (2009). Omega.
PROBLEMES
van Eikeren P. (1987) Guía de Principios de Bioquímica de Lehninger. Ed. Omega.
Macarulla J.M., Marino A. i Macarulla A. (1992) Bioquímica Cuantitativa. Ed. Reverté.
Segel I.H. (1976) Biochemical Calculations. Ed. Wiley & Sons.
Programari
No hi ha programari per aquesta assignatura
Llista d'idiomes
| Nom | Grup | Idioma | Semestre | Torn |
|---|---|---|---|---|
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 211 | Català/Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PAUL) Pràctiques d'aula | 212 | Català/Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 211 | Català/Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 212 | Català/Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (PLAB) Pràctiques de laboratori | 213 | Català/Espanyol | primer quadrimestre | matí-mixt |
| (TE) Teoria | 21 | Català/Espanyol | primer quadrimestre | tarda |