Logo UAB
2023/2024

Tècniques de Simulació

Codi: 43440 Crèdits: 6
Titulació Tipus Curs Semestre
4314939 Nanociència i Nanotecnologia Avançades OT 0 1

Professor/a de contacte

Nom:
Xavier Cartoixa Soler
Correu electrònic:
xavier.cartoixa@uab.cat

Idiomes dels grups

Podeu accedir-hi des d'aquest enllaç. Per consultar l'idioma us caldrà introduir el CODI de l'assignatura. Tingueu en compte que la informació és provisional fins a 30 de novembre de 2023.

Equip docent

Francisco Torres Canals
Laura Masgrau Fontanet
Xavier Solans Monfort

Prerequisits

Caldran nocions bàsiques de mecànica quàntica per la part del curs d'ab initio.


Objectius

Introducció a l'ús de software pel càlcul de propietats físiques i químiques a la nanoescala, i perspectiva dels formalismes subjacents.


Competències

  • Buscar informació en la literatura científica fent servir els canals apropiats i integrar aquesta informació per plantejar i contextualitzar un tema de recerca.
  • Dominar la terminologia científica i desenvolupar l'habilitat d'argumentar els resultats de la recerca en el context de la producció científica, per comprendre i interactuar eficaçment amb altres professionals.
  • Identificar les tècniques de caracterització i anàlisi pròpies de la nanotecnologia i conèixer-ne els fonaments, dins de l?especialitat pròpia.
  • Que els estudiants sàpiguin aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
  • Que els estudiants sàpiguin comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats
  • Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit

Resultats d'aprenentatge

  1. Analitzar la complexitat subjacent i els límits computacionals dels diferents mètodes de resolució de les equacions descriptives del model.
  2. Buscar informació en la literatura científica fent servir els canals apropiats i integrar aquesta informació per plantejar i contextualitzar un tema de recerca.
  3. Dominar la terminologia científica i desenvolupar l'habilitat d'argumentar els resultats de la recerca en el context de la producció científica, per comprendre i interactuar eficaçment amb altres professionals.
  4. Identificar la tècnica computacional més adequada per al problema abordat
  5. Identificar les equacions que regeixen la dinàmica molecular newtoniana, el transport electrònic de primers principis i la dinàmica d'estructures.
  6. Interpretar les capacitats d'una tècnica de simulació i les limitacions fonamentals en funció dels termes que el model incorpora.
  7. Que els estudiants sàpiguin aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
  8. Que els estudiants sàpiguin comunicar les seves conclusions, així com els coneixements i les raons últimes que les fonamenten, a públics especialitzats i no especialitzats d'una manera clara i sense ambigüitats
  9. Que els estudiants tinguin les habilitats d'aprenentatge que els permetin continuar estudiant, en gran manera, amb treball autònom a autodirigit
  10. Utilitzar autònomament eines de simulació per comprendre millor situacions experimentals.
  11. Utilitzar de manera eficient tècniques computacionals per estudiar problemes científics relatius als materials i a la nanoescala.

Continguts

  • Breu introducció a Linux.
  • Mètodes ab-initio pel transport electrònic: teoria de funcional densitat (DFT), equacions de Kohn-Sham, ones planes i orbitals quasi-atòmics. Fonaments del transport balístic. Funcions de Green fora del equilibri. Obtenció de coeficients de transmissió amb TRANSIESTA – sessions pràctiques: transport a través d'una molècula i de nanocintes de grafè.
  • Dinàmica molecular (MD) amb force fields clàssics: col·lectivitats micro/macrocanòniques, termostats, forces intermoleculars, force fields per sistemes biològics. Codi Lammps – sessions pràctiques: aigua a través d'un nanotub de carboni, i enllaç antigen-anticos.
  • Models de continu: equacions de continuïtat: massa, moment, energia. Difusió, conducció de la calor, fluïds, elasticitat, formalisme k.p. Codi Elmer Multiphysics – sessions pràctiques: vibracions en nanofils de Si, i flexió d'un pont de Si degut a la dilatació tèrmica.

Metodologia

Uns 2/5 de les classes seran tradicionals, i els 3/5 restants seran sessions pràctiques amb els diferents codis. Les activitats fora de classe inclouran la lectura d'articles d'investigació, i dur a terme petits treballs/simulacions expandint el que s'ha explicat a classe.

Les classes magistrals i demostracions pràctiques podran ser online en funció de la situació sanitària.

Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.


Activitats formatives

Títol Hores ECTS Resultats d'aprenentatge
Tipus: Dirigides      
Classe magistral 15 0,6 1, 4, 5, 6, 7, 11
Tipus: Supervisades      
Demostracions pràctiques 22 0,88 1, 5, 6, 9, 10, 11
Tipus: Autònomes      
Treball autònom 43 1,72 2, 7, 9, 10

Avaluació

Es podrà requerir un examen final en casos molt específics.

Aquest mòdul no preveu el sistema d'avaluació única.


Activitats d'avaluació continuada

Títol Pes Hores ECTS Resultats d'aprenentatge
Assistència i participació a classe 5%-10% 0 0 3, 8
Exposició d'un article 10%-15% 5 0,2 1, 2, 3, 4, 6, 8, 9
Informes de pràctiques - Dinàmica Molecular 20%-25% 20 0,8 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11
Informes de pràctiques - Mètodes de continu 25%-30% 20 0,8 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11
Informes de pràctiques - Primers principis 30%-35% 25 1 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11

Bibliografia

J. M. Thijssen. Computational Physics (Cambridge University Press, 1999)

R. M. Martin. Electronic Structure: Basic Theory and Practical Methods (Cambridge University Press, 2004).

S. Datta, Electronic transport in mesoscopic systems (Cambridge University Press, 1995)

D. C. Rapaport, The Art of Molecular Dynamics Simulations (Cambridge University Press, 1995)

D. Frenkel, B. Smit, Understanding Molecular Simulations: from algorithms to applications, Academic Press (1996).

O.C. Zienkiewicz, R.L. Taylor and J.Z. Zhu, The Finite Element Method: Its Basis and Fundamentals (6th Ed, Elsevier Butterworth-Heinemann, 2005) Sections 3.1-3.3


Programari

Cal ordinador configurat per accedir per ssh, amb capacitats gràfiques, a màquines remotes. S'oferirà ajut per configurar-ho.