Microbiologia Ambiental Avançada
Codi: 42937 Crèdits: 9| Titulació | Tipus | Curs | Semestre |
|---|---|---|---|
| 4313775 Microbiologia Aplicada | OB | 0 | 2 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Olga Sanchez Martinez
- Correu electrònic:
- olga.sanchez@uab.cat
Utilització d'idiomes a l'assignatura
- Llengua vehicular majoritària:
- espanyol (spa)
Altres indicacions sobre les llengües
Hi pot haver continguts en català o en anglès.Equip docent
- Nuria Gaju Ricart
- Jordi Mas Gordi
- Maria Ramos Martinez Alonso
- Antonio Sole Cornella
Prerequisits
Es recomana als estudiants que portin a terme una revisió de conceptes bàsics de microbiologia, així com d'aspectes relacionats amb l'ecologia microbiana, la microbiologia ambiental i l'aplicació de tècniques moleculars en aquestes disciplines.
Objectius
En aquest mòdul es proporcionaran a l'estudiant coneixements teòrics i pràctics sobre metodologies avançades per a l'estudi dels microorganismes en ambients naturals i artificials. L'aprenentatge i la comprensió d'aquestes metodologies li permetrà adquirir el bagatge necessari per a la utilització dels microorganismes en la resolució de problemes mediambientals.
Competències
- Aplicar les metodologies adequades per a la presa de mostres, la caracterització i l'anàlisi de poblacions i de comunitats microbianes.
- Dissenyar eines i estratègies basades en microorganismes per tal d'optimitzar processos industrials, valorar l'impacte ambiental de l'activitat humana i recuperar ambients contaminats.
- Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
- Tenir coneixements que aportin la base o l'oportunitat de ser originals en el desenvolupament o l'aplicació d'idees, sovint en un context de recerca.
- Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics relacionats amb la microbiologia i les ciències afins.
- Utilitzar la terminologia científica per argumentar els resultats de la recerca i saber-los comunicar oralment i per escrit.
Resultats d'aprenentatge
- Aplicar estratègies i tècniques de mostreig apropiades per a comunitats microbianes en ecosistemes naturals i artificials.
- Caracteritzar poblacions i comunitats de microorganismes procedents de mostres ambientals.
- Conèixer els diferents bioindicadors i bioassajos basats en microorganismes que permeten valorar impactes ambientals.
- Conèixer procediments i estratègies basades en microorganismes per al control de plagues i malalties.
- Dissenyar estratègies de bioremediació i de biorecuperació basades en l'ús de microorganismes.
- Que els estudiants sàpiguen aplicar els coneixements adquirits i la seva capacitat de resolució de problemes en entorns nous o poc coneguts dins de contextos més amplis (o multidisciplinaris) relacionats amb la seva àrea d'estudi.
- Reconèixer el paper dels microorganismes com a agents causals de deteriorament.
- Tenir coneixements que aportin la base o l'oportunitat de ser originals en el desenvolupament o l'aplicació d'idees, sovint en un context de recerca.
- Utilitzar i gestionar informació bibliogràfica i recursos informàtics relacionats amb la microbiologia i les ciències afins.
- Utilitzar la terminologia científica per argumentar els resultats de la recerca i saber-los comunicar oralment i per escrit.
Continguts
1. Conceptes bàsics sobre disseny experimental per a l'estudi de comunitats microbianes
2. Anàlisi del biòtop i la biocenosi
3. Models experimentals de laboratori per a l'estudi de comunitats microbianes
4. Microscòpia òptica i electrònica aplicada a la microbiologia ambiental
5. Ecologia microbiana molecular
6. Anàlisi de l'impacte de l'activitat humana sobre els ambients naturals
7. Contaminació ambiental i bioremediació
Metodologia
La metodologia docent inclou tres tipus d'activitats, les quals s'han programat de forma integrada amb el propòsit que al final l'estudiant adquireixi les competències indicades en aquesta guia.
Bloc de teoria
S'impartiran classes de teoria expositives on s'explicaran els continguts bàsics del mòdul.
Seminaris especialitzats
També es duran a terme seminaris, impartits per experts en els diferents àmbits de la microbiologia ambiental.
Bloc de pràctiques
Inclou:
Pràctiques de laboratori experimentals: es realitzaran diferents sessions sobre tècniques de microscòpia d'alta resolució, tant òptica com electrònica, per determinar canvis en la biodiversitat i la captació de metalls per part dels microorganismes en processos de bioreparació d'ambients contaminats.
Pràctiques d'aula: Es realitzaran vàries sessions sobre disseny experimental per la presa de mostres ambientals i la caracterització de la diversitat microbiana en mostres ambientals, així com diverses classes en què es resoldran diferents problemes reals o hipotètics de caire ambiental. S'utilitzarà una metodologia ABP (aprenentatge basat en problemes), en què els estudiants abordaran els casos plantejats treballant en grups reduïts a l'aula.
Finalment, es realitzaran diferents exposicions orals a classe per resoldre els problemes plantejats.
Pràctiques d'informàtica: es duran a terme diverses sessions a l'aula d'informàtica per introduir a l'estudiant en el tractament i anàlisi informàtica de dades moleculars per a l'estudi de la diversitat de les comunitats microbianes i els canvis que aquestes experimenten en resposta a diferents factors ambientals o actuacions humanes. Es treballaran els següents aspectes:
1. Selecció d'encebadors mitjançant un estudi in silico per dur a terme un estudi de diversitat microbiana d'un determinat ambient.
2. Anàlisi estadística de perfils genètics obtinguts mitjançant tècniques de fingerprinting.
3. Deteminació d'índexs de diversitat a partir del perfil genètic de la comunitat microbiana.
4. Edició de seqüències i determinació de l'afiliació filogenètica deles mateixes.
Nota: es reservaran 15 minuts d'una classe, dins del calendari establert pel centre/titulació, per a la complementació per part de l'alumnat de les enquestes d'avaluació de l'actuació del professorat i d'avaluació de l'assignatura/mòdul.
Activitats formatives
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Classes de teoria | 8 | 0,32 | 3, 8 |
| Pràctiques d'aula | 21 | 0,84 | 3, 6, 9, 10 |
| Pràctiques de laboratori experimentals i d'informàtica | 16 | 0,64 | 1, 6, 8, 9, 10 |
| Seminaris d'experts | 10 | 0,4 | 3, 8 |
| Tipus: Supervisades | |||
| Tutories de les practiques d'aula | 12 | 0,48 | 1, 4, 6, 9, 10 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Cerca i gestió de la informació | 30 | 1,2 | 9, 10 |
| Estudi | 25 | 1 | 1, 3, 4, 6, 7, 10 |
| Lectura de textos | 30 | 1,2 | 3, 4, 8, 9, 10 |
| Preparacio dels casos practics | 30 | 1,2 | 1, 2, 3, 4, 5, 7, 9 |
| Preparacio dels exercicis de practiques de laboratori experimentals i d'informatica | 15 | 0,6 | 6, 8, 9, 10 |
| Preparació de les presentacions orals | 25 | 1 | 6, 9, 10 |
Avaluació
Les competències específiques i transversals s'avaluaran mitjançant diferents activitats:
1. Prova escrita (40%): Es realitzarà un examen escrit dels continguts teoricopràctics. Aquest examen inclourà preguntes curtes i /o de tipus test.
2. Avaluació del bloc de classes pràctiques (60%). Es valorarà el treball que es realitzi al laboratori i a les aules, així com la resolució dels exercicis plantejats durant la resolució de les pràctiques.
Consideracions finals:
Les classes pràctiques no seran recuperables. Els estudiants que no superin l'avaluació teórico-pràctica, la podran recuperar en la data programada a tal efecte. Per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final.
Per aprovar el mòdul és obligatòria l'assistència a totes les classes teòriques i pràctiques.
Activitats d'avaluació
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Avaluacio de les classes practiques d'aula | 35 | 0 | 0 | 1, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 |
| Avaluacio de les practiques a l'aula d'informatica | 15 | 0 | 0 | 9, 10 |
| Avaluacio de les practiques experimentals de laboratori | 10 | 0 | 0 | 2, 10 |
| Avaluació teoricopràctica | 40 | 3 | 0,12 | 3, 4, 6, 7, 9, 10 |
Bibliografia
Serà competència de l'estudiant la cerca i consulta de bibliografia necessària pel seguiment i consecució del mòdul. En aquests enllaços, es pot trobar una infografia que ha preparat el Servei de Biblioteques per facilitar la localització de llibres electrònics: https://ddd.uab.cat i https://ddd.uab.cat/pub/guibib/224929/bibrecdigitals.pdf
El professorat assessorarà degudament als alumnes en aquest aspecte.
Programari
El programari a utilitzar correspon als programes habituals de l'entorn Microsoft. Es podrà utilitzar algun programari més específic d'accés lliure i que l'alumne cercarà en funció de les seves necessitats per a la resolució d'exercicis a l'aula d'informàtica.