Titulación | Tipo | Curso | Semestre |
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2500252 Bioquímica | OB | 3 | 2 |
No existen prerequisitos para esta asignatura. No obstante, se recomienda repasar los conceptos adquiridos en las asignaturas de "Biologia Molecular" y "Química i Enginyeria de Proteïnes" impartidas durante el segundo curso del grado.
También es recomendable que los alumnos posean un conocimiento suficiente de la lengua inglesa que les permita consultar sin dificultad las fuentes bibliográficas y recursos educativos "on-line" que la profesora propondrá a lo largo de las sesiones.
La materia impartida durante este curso proporciona al alumno una visión introductoria a la bioinformática. Esta asignatura está dirigida a estudiantes de Bioquímica de 3er curso (6º semestre).
Al superar dicha asignatura, los alumnos deben ser capaces de:
-Dominar las herramientas bioinformáticas basadas en web o interfaz gráfica de usuario, para el estudio de secuencias.
-Obtener, alinear, visualizar y comparar secuencias.
-Inferir relaciones filogenéticas entre secuencias.
-Conocer las diferentes herramientas predictivas para secuencias y saber escoger la más adecuada para cada pregunta experimental.
-Ser capaz de responder a preguntas de interés bioquímico mediante herramientas bioinformáticas.
Clases teóricas. Las clases teóricas cubrirán los fundamentos teóricos de la asignatura, y serán evaluadas en el exámen.
Aprendizaje autónomo- Actividades propuestas vía MOODLE. A lo largo de las 8 semanas de la asignatura, la profesora irá proponiendo distintas actividades autónomas, el resultado de las cuales se entregará a través de la plataforma MOODLE. Se propondrá una variedad de actividades/problemas que podrán consistir en la visualizaciónd e tutoriales, ejecución de procedimientos, realización de cuestionarios, dependiendo de la temática abordada y en estrecha relación con la misma. Podrá ser necesario que previamente a una sesión de problemas deba realizarse alguna actividad en MOODLE con el objeto de que los alumnos aprovechen mejor la sesión de problemas.
Aprendizaje autónomo- Resolución de un caso práctico. Se planteará la resolución de un caso práctico en grupos de 2-3 personas (o individual si se prefiere). Se trata de un ejercicio integrador, que no necesariamente será el mismo para todos los alumnos, que deberá resolverse de forma autónoma por parte de los grupos de trabajo. Se dispondrá de varias semanas para su realización, y los grupos de trabajo presentarán en clase el resultado de su trabajo, a través de una exposición breve (5-10 min). El power-point o similar, se entregará a través de MOODLE.
Aprendizaje autónomo: Estudio.
Clases de problemas. Las clases de problemas incidirán en los aspectos prácticos de la asignatura, y se espera que los alumns adquieran la destreza necesaria en la búsqueda e interpretación de información, así como en la ejecución de procedimientos relevantes en los aspectos cubiertos en cada clase. Los aspectos tratados en las clases de problemas se evaluarán en el exámen.
Tutories. Sesiones individuales o en grupos pequeños para la resolución de dudas relacionadas con la asignatura. A demanda de los alumnos y a pactar día/hora con la profesora. Se recomienda especialmente usar las tutorías cuando de trabaje en el caso práctico.
Nota: se reservarán 15 minutos de una clase dentro del calendario establecido por el centro o por la titulación para que el alumnado rellene las encuestas de evaluación de la actuación del profesorado y de evaluación de la asignatura o módulo.
Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
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Tipo: Dirigidas | |||
Clases teóricas | 10 | 0,4 | 6, 10, 11, 12, 13 |
Prácticas en aula de informática o problemas | 16 | 0,64 | 4, 5, 6, 7, 8, 11, 12, 13, 14, 15 |
Tipo: Supervisadas | |||
Tutorías | 5 | 0,2 | 6, 8, 10, 11, 12, 13 |
Tipo: Autónomas | |||
Actividades propuestas vía MOODLE | 9 | 0,36 | 4, 7, 10, 11, 12, 15 |
Estudio | 10 | 0,4 | 4, 6, 7, 8, 11, 12, 13, 15 |
Resolución de un caso práctico | 15 | 0,6 | 4, 5, 6, 7, 10, 11, 12, 13, 15 |
Habrá cuatro tipos de evaluación:
1) Exámen. El exámen evaluará tanto los conceptos teóricos como de tipo aplicado que se traten en las sesiones. Podrá consistir en preguntas cortas y/o preguntas tipo test y/o de análisis de resultados o datos proporcionados por la profesora. La prueba ponderará un 50% de la nota final, y se realizará de forma individual, preferiblemente en un aula de informática de la facultad. Para superar el exámen, el alumno deberá alcanzar una nota igual o superior a 5/10 y se podrá recuperar al final del semestre en el exámen de recuperación.
2) Entrega de actividades propuestas a través de MOODLE. La suma total de la puntuación de estas actividades ponderará un un 20% de la ntoa final y no será recuperable. Tampoco podrá puntuarse en este apartado si se entregan las actividades fuera de plazo.
3) Resolución de un caso práctico. El peso de esta parte será de un 30% de la nota, que se subdividirá en:
-un 25% para la presentación oral i el “power point”, evaluada por la profesora. No será recuperable.
-un 5% para la evaluación entre iguales. No será recuperable.
Para superar la asignatura, es necesario que se cumplan los dos criterios siguientes:
a) aprobar el exámen con una nota final igual o superior a 5 y
b) obtener una calificación final igual o superior a 5, después de calcular la media ponderada de las cuatro actividades deevaluación (exámen, activitades MOODLE, trabajo en grupo evaluado por la profesora y por los compañeros).
Exámen de recuperación y mejora de nota
El exámen de recuperación tendrá el mismo formato que la prueba escrita final, es decir, podrá consistir en preguntas cortas y/o preguntas tipo test y/o de análisis de resultados o datos proporcionados por la profesora. Los alumnos que deseen mejorar la nota, podrán presentarse a un exámen de mejora de nota al final del semestrem en la fecha y hora programada para el exámen de recuperación. El grado de dificultad de dicha prueba podrá ser superior a la de las demás pruebas escritas. El alumno que se presente a mejorar nota renuncia a la nota obtenida en el exámen anterior. El alumno que desee presentarse al exámen de mejora de nota deberá avisar a la profesora con 48 de anticipación, con el objeto de que se pueda planificar la logística (reserva aulas, etc). La revisión del exámen se realizará en día y lugar concertados, entre 1 y 7 días hábiles después de la publicación de las notas. Los alumnos que no puedan asistir al exámen por causa justificada y aporten la documentación oficila correspondiente al Coordinador de Grado, tendrán derecho a realizar el exámen en otra fecha que podría combinar la resolución de problemas con la respuesta oral a preguntas planteadas por la profesora. El Coordinador de Grado velará por la concreción de la misma con el profesor de la asignatura afectada. Cualquier aspecto no contemplado por esta guía se regirápor la normativa de evaluación de la Facultad de Biociencias. Para participar en la recuperación, el laumno deberá haber sido previamente evaluado por un conjunto de actividades el peso de las cuales equivalga a un mínimo de dos tercios de la calificación total de la asignatura. Por tanto, el alumno obtendrá la calificación de “No Evaluable” cuando las actividades de evaluación relaizadas tengan una ponderación inferior al 67% en la calificación final.
Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
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Entrega de actividades propuestas a través de MOODLE | 20% | 2 | 0,08 | 4, 5, 6, 7, 8, 11, 12, 13, 15 |
Evaluación entre iguales (sobre el caso práctico) | 5% | 2 | 0,08 | 1, 2, 3, 5, 8, 9 |
Exámen | 50% | 4 | 0,16 | 4, 6, 7, 8, 10, 11, 12, 13, 15 |
Resolución de un caso práctico | 25% | 2 | 0,08 | 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 |
Programes:
Jalview: https://www.jalview.org/
MEGA X: https://www.megasoftware.net/
Notepad++: https://notepad-plus-plus.org/downloads/ç
Icn3d: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/icn3d/icn3d-3.2.0.zip
PyMol: https://pymol.org/2/
Pàgines web i Webservers:
https://services.healthtech.dtu.dk/