Biología de Sistemas de las Plantas
Código: 44787 Créditos ECTS: 6| Titulación | Tipo | Curso | Semestre |
|---|---|---|---|
| 4318297 Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales | OT | 0 | 2 |
Contacto
- Nombre:
- Ana Montserrat Martin Hernandez
- Correo electrónico:
- anamontserrat.martin@uab.cat
Idiomas de los grupos
Puede consutarlo a través de este enlace. Para consultar el idioma necesitará introducir el CÓDIGO de la asignatura. Tenga en cuenta que la información es provisional hasta el 30 de noviembre del 2023.
Equipo docente
- Luisa Maria Lois Rojas
- Juan Jose Lopez-Moya Gomez
- Elena Monte Collado
Equipo docente externo a la UAB
- Iban Eduardo
- Jae-Seong Yang
- Martí Quevedo
Prerrequisitos
Conocimientos básicos de Genética
Objetivos y contextualización
Proporcionar a los alumnos una visión global y actual de las técnicas, fundamentos y aplicaciones de la
Genómica Vegetal e introducirlos en la Biología de Sistemas de las plantas. Los objetivos específicos incluyen
la comprensión de los siguientes aspectos: la diversidad y complejidad de los genomas vegetales, las técnicas
empleadas habitualmente en los estudios de genómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica y las
aplicacionesa la mejora genética de las plantas cultivadas, así como el uso de las matemáticas para el
modelado predictivo a través de la integración de los datos de las diferentes -ómicas.
Resultados de aprendizaje
- CA12 (Competencia) Utilizar nuevas herramientas bioinformáticas para describir modelos predictivos de datos experimentales ómicos en el ámbito de la Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales.
- CA17 (Competencia) Aplicar la terminología científica para argumentar los resultados de la investigación en mejora genética de plantas de cultivo y comunicarlos oralmente y por escrito en un entorno internacional.
- KA15 (Conocimiento) Describir los resultados de los análisis de datos derivados de estudios proteómicos, y metabolómicos aplicados a la mejora de plantas de cultivo.
- KA16 (Conocimiento) Seleccionar metodologías de estudio en genómica vegetal y estudio de casos prácticos a través de múltiples "omics".
- SA28 (Habilidad) Comunicar los resultados de la investigación en el ámbito de la Biología, Genómica y Biotecnología Vegetales en inglés oralmente y por escrito utilizando una terminología científica adecuada.
- SA29 (Habilidad) Aplicar los conocimientos de genética molecular y la mejora de las plantas de cultivo en diferentes ámbitos científicos e industriales.
- SA30 (Habilidad) Aplicar los métodos y técnicas empleadas habitualmente en los estudios de genómica, fenómica, transcriptómica, proteómica y metabolómica.
- SA31 (Habilidad) Aplicar herramientas bioinformáticas al estudio genético, evolutivo y funcional de los vegetales e interpretar los resultados obtenidos de los experimentos realizados.
Contenido
Biología de Sistemas: conceptos, metodología y estudios de casos utilizando múltiples -ómicas. El caso de
estudio será la aparición de una nueva enfermedad que afecta y mata todas las variedades de tomate. Los
estudiantes realizarán un viaje a través de todas las -ómicas para descubrir la causa y buscar una solución
científica viable para su aplicación en la mejora de plantas cultivadas.
Específicamente,
Se utilizarán aplicaciones prácticas de métodos y técnicas en fenómica y genómica vegetales, incluyendo el
uso de marcadores moleculares en la mejora vegetal. Importancia de los QTLs en este problema.
Análisis y aplicación de datos derivados de experimentos de genómica y de transcriptómica para limitar el
problema.
Análisis y aplicación de datos derivados de los experimentos de proteómica, interactómica y metabolómica
para encontrar una solución al problema.
Análisis integrado del caso de estudio aplicados, incluyendo la modelización computacional, para la mejora de
plantas de cultivo.
Metodología
Conferencias y charlas de expertos
Problemas y casos prácticos
Preparación de informes
Estudio personal
Nota: se reservarán 15 minutos de una clase dentro del calendario establecido por el centro o por la titulación para que el alumnado rellene las encuestas de evaluación de la actuación del profesorado y de evaluación de la asignatura o módulo.
Actividades
| Título | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|
| Tipo: Dirigidas | |||
| Conferencias y charlas de expertos | 12 | 0,48 | CA12, KA16, SA28, SA30, CA12 |
| Problemas y casos prácticos | 18 | 0,72 | CA17, KA16, SA28, SA29, CA17 |
| Tipo: Supervisadas | |||
| Preparación de informes | 35 | 1,4 | CA17, KA15, SA28, CA17 |
| Tipo: Autónomas | |||
| Estudio Personal | 84 | 3,36 | SA31, SA31 |
Evaluación
Evaluación continua 10%
Informe 60%
Cuestionario final 30%
Esta asignatura/módulo no contempla el sistema de evaluación única.
Actividades de evaluación continuada
| Título | Peso | Horas | ECTS | Resultados de aprendizaje |
|---|---|---|---|---|
| Conferencias y charlas de expertos | 10% | 0 | 0 | CA12, CA17, KA16, SA29, SA30, SA31 |
| Cuestionario final | 30% | 1 | 0,04 | SA29, SA30, SA31 |
| Informe | 60% | 0 | 0 | CA17, KA15, SA28, SA29, SA30, SA31 |
Bibliografía
Yunbi Xu Molecular Plant Breeding. CAB International Oxfordshire, UK disponible online a Biblioteca UAB
:http://www.cabi.org/cabebooks/FullTextPDF/2010/20103101750.pdf
Artículos y revisiones específicas recomendados en clase.
Software
MapQTL 6.0
JoinMap 5.0
R
RStudio