Laboratori integrat 3
Codi: 100926 Crèdits: 3| Titulació | Tipus | Curs | Semestre |
|---|---|---|---|
| 2500253 Biotecnologia | OB | 2 | 1 |
Professor/a de contacte
- Nom:
- Sandra Villegas Hernández
- Correu electrònic:
- Sandra.Villegas@uab.cat
Utilització d'idiomes a l'assignatura
- Llengua vehicular majoritària:
- català (cat)
- Grup íntegre en anglès:
- No
- Grup íntegre en català:
- Sí
- Grup íntegre en espanyol:
- No
Equip docent
- Josep Maria Burgués Badía
- Antonio Javier Moral Vico
- Ugutz Unzueta Elorza
Prerequisits
Cal estar cursant simultàniament o haver cursat les assignatures de teoria corresponents als continguts de les pràctiques de laboratori.
Cal haver superat el test de seguretat i bioseguretat als laboratoris. El tests es responen en el corresponent espai del Campus Virtual i la informació que cal consultar es troba a l’espai de comunicació del Grau en Biotecnologia. L'alumne ha de ser coneixedor de la normativa de funcionament i de seguretat dels laboratoris de la facultat de biociències i acceptar que la complirà. Per això entregara signat/s el/s document/s que ho certifiquin al professor responsable de cada mòdul el primer dia de pràctiques abans de començar-les.
Objectius
El Laboratori Integrat 3 és la tercera assignatura d’un conjunt de 6 que es distribueixen a llarg del 6 semestres corresponents als tres primers cursos del Grau en Biotecnologia.
Els objectius formatius d’aquestes assignatures es centren en l’adquisició de competències en el marc de la formació pràctica de l’alumne.
Els continguts s’organitzen en ordre creixent de complexitat i associats a les necessitats i a l’avenç dels continguts teòrics del Grau.
El Laboratori Integrat 3 té com objectius formatius l’adquisició de competències pràctiques en 4 continguts específics:
- Fenòmens de transport
- Microbiologia
- Biologia i Genètica Molecular
- Probabilitat i Estadística
Els coneixements de probabilitat i estadística des d’un punt de vista aplicat són claus per poder organitzar i interpretar dades experimentals ens els diferents àmbits del Grau.
La resta de pràctiques en el laboratori es centra en l’aprenentatge de tècniques bàsiques específiques de cada camp i en les característiques pròpies del treball en el laboratori.
Competències
- Adquirir nous coneixements i tècniques de forma autònoma.
- Aplicar els recursos informàtics per a la comunicació, la recerca d'informació, el tractament de dades i el càlcul.
- Aplicar les normes generals de seguretat i funcionament d'un laboratori i les normatives específiques per a la manipulació de diferents sistemes biològics.
- Aplicar les principals tècniques associades a l'ús de sistemes biològics: DNA recombinant i clonació, cultius cel·lulars, manipulació de virus, bacteris i cèl·lules animals i vegetals, tècniques immunològiques, tècniques de microscòpia, proteïnes recombinants i mètodes de separació i caracterització de biomolècules.
- Buscar, obtenir i interpretar la informació de les principals bases de dades biològiques, bibliogràfiques i de patents i usar les eines bioinformàtiques bàsiques.
- Descriure les bases del disseny i del funcionament de bioreactors i calcular, interpretar i racionalitzar els paràmetres rellevants en fenòmens de transport i els balanços de matèria i energia en els processos bioindustrials.
- Dissenyar experiments de continuació per resoldre un problema.
- Interpretar resultats experimentals i identificar elements consistents i inconsistents.
- Liderar i dirigir equips de treball, i desenvolupar les capacitats d'organització i planificació.
- Pensar d'una forma integrada i abordar els problemes des de diferents perspectives.
- Prendre decisions.
- Treballar de forma individual i en equip.
Resultats d'aprenentatge
- Adquirir nous coneixements i tècniques de forma autònoma.
- Aplicar correctament els diferents processos d'eliminació de residus.
- Aplicar els principis d'esterilitat a processos de manipulació i recompte de microorganismes.
- Aplicar els recursos informàtics per a la comunicació, la recerca d'informació, el tractament de dades i el càlcul.
- Aplicar les normes generals de seguretat d'un laboratori de biotecnologia.
- Aplicar les tècniques fonamentals per a l'anàlisi, purificació i caracterització de biomolècules.
- Dissenyar experiments de continuació per resoldre un problema.
- Extreure de les bases de dades informació complementària i de suport per a l'anàlisi dels resultats i l'elaboració de les memòries resultants del treball experimental.
- Interpretar resultats experimentals i identificar elements consistents i inconsistents.
- Liderar i dirigir equips de treball, i desenvolupar les capacitats d'organització i planificació.
- Obtenir dades experimentals rellevants per al càlcul dels fenòmens de transport i el càlcul de balanços de matèria i energia.
- Pensar d'una forma integrada i abordar els problemes des de diferents perspectives.
- Prendre decisions.
- Treballar de forma individual i en equip.
- Utilitzar la metodologia adequada per a l'estudi dels diferents tipus de mostres biològiques.
- Utilitzar les tècniques bàsiques de manipulació, identificació, visualització per microscòpia i recompte de virus.
- Utilitzar les tècniques bàsiques de manipulació, separació, detecció i anàlisi de proteïnes i àcids nucleics.
- Utilitzar les tècniques bàsiques de preparació i observació de mostres al microscopi òptic i electrònic.
- Utilitzar les tècniques d'identificació de microorganismes basades en les seves capacitats metabòliques.
- Utilitzar les tècniques de cultius de cèl·lules procariotes, eucariotes i de manipulació de sistemes biològics.
Continguts
L’assignatura s’estructura en 4 mòduls.
Probabilitat i Estadística
Continguts: s’organitzen en diverses sessions que es fan a l’aula d’informàtica. A les successives sessions de pràctiques es farà anàlisi de dades, desenvolupant progressivament els mètodes següents:
1. Estadística descriptiva d'una o més variables.
2. Càlcul de probabilitats i simulació.
3. Tests d'hipòtesis.
Es proporcionarà material per a establir les bases de l’Anàlisi de la variància i regressió.
Fenòmens de transport
Continguts: s’organitzen en diverses sessions que es fan al laboratori C i en les que es plantejarà:
1. Determinació experimental de viscositats i densitats.
Ús de densímetres i viscosímetres. Determinació de la densitat i la viscositat de diferents solucions aquoses. Observació experimental de la calor de dissolució i mescla.
2. Determinació experimental de difusivitats de gasos.
Avaluació de la difusivitat molecular de l’acetona en aire. Comparació amb els valors teòrics.
Microbiologia
Continguts: s'organitzen en diverses sessions que es fan al laboratori A de Biotecnologia. En aquestes sessions es treballarà en 6 pràctiques que solaparan parcialment en el temps i que es complementaran amb matèria addicional facilitat a través de campus virtual.
1. Material i equipament bàsic per a l'observació, manipulació, aïllament, caracterització i identificació de microorganismes.
2. Tècniques d'esterilització i preparació de medis de cultiu.
Estudi de les tècniques d'esterilització. Estudi de la composició i preparació de medis de cultiu. Preparació de material. Esterilització amb autoclau, estufa i filtració. Control d'esterilitat. Control de la tècnica asèptica.
3. Aplicació de les tècniques de microbiologia bàsica per a l'observació de microorganismes.
Tincions i motilitat. Observació de microorganismes in vivo amb microscòpia de camp clar.
Diferenciació dels grans grups microbians. Tècniques de tinció de procariotes: tincions simples i diferencials.
4.Aplicació els mètodes de recompte de microorganismes.
Càlcul de cèl·lules viables i totals. Disseny de bancs de dilucions i sembra en placa en superfície.
Determinació del nombre de cèl·lules vives i mortes.
5. Aplicació de les tècniques de microbiologia bàsica per a l'aïllament i identificació de microorganismes.
Mètodes ràpids per a l'aïllament de microorganismes. Disseny de mètodes d'enriquiment i de selecció. Obtenció de cultius purs. Obtenció de cultius confluents per sembra en superfície i en massa. Sembra per esgotament. Proves bioquímiques i mètodes ràpids per a la identificació de microorganismes.
6.Ubicuidadi diversitat microbiana.
Detectar la presència de microorganismes en tot tipus d'ambients i observar la seva capacitat de propagació i la seva elevada diversitat.
Biologia i Genètica Molecular
Continguts: s'organitzen en diverses sessions que es fan al laboratori A de Biotecnologia. En aquestes sessions es treballarà en 3 pràctiques que solaparan parcialment en el temps.
1. Conceptes bàsics del clonatge de DNA
L'objectiu de la pràctica és presentar de manera integrada alguna de les etapes i metodologies bàsiques subjacents al clonatge de DNA, com ara transformació de cèl·lules competents d'E. coli, selecció de transformants, cribratge de característiques fenotípiques per rèplica en plaques de medis específics, i obtenció, digestió amb enzims de restricció i anàlisi de DNA plasmídic.
2. Anàlisi espectrofotomètrica de DNA
S'obtindrà l'espectre d'absorció UV i es determinarà la concentració i puresa de la mostra de DNA analitzada. S'observarà l'efecte hipercròmic per desnaturalització del DNA.
3. Superhelicitat del DNA
Se observará la acción de la topoisomerasa I sobre la topología del pDNA. El ensayo en presencia del inhibidor camptotecina permitirá analizar el mecanismo de la actividad enzimática.
Metodologia
L’assistència a les classes d’aquesta assignatura és obligatòria atès que impliquen una adquisició de competències basades en el treball pràctic.
Per poder assistir a les pràctiques experimentals cal que l’estudiant justifiqui haver superat les proves de bioseguretat i de seguretat que trobarà en el Campus Virtual i ser coneixedor i acceptar les normes de funcionament dels laboratoris de la Facultat de Biociències. Per la qual cosa entregarà signat/s el/s document/s corresponents al coordinador de cada mòdul el primer dia de pràctiques.
Hi ha programats 3 grups de pràctiques pel mòdul de Probabilitat i Estadística i 4 grups per la resta. La distribució dels grups es podrà consultar en el Campus virtual a l’espai de comunicació del Grau de Biotecnologia.
Probabilitat i Estadística
Classes a les aules d'informàtica que inclouen l'entrega dels enunciats de les pràctiques, la presentació del professor i la realització de la pràctica.
Es publicarà amb antelació al Campus Virtual un document amb el guió de les pràctiques.
Cal entregar els resultat de la practica mateixa i això s'avalua. Al començament del curs publicarem al CV un format exacte per a la realització de les pràctiques.
Fenòmens de transport, Microbiologia i Fisiologia Animal
Classes pràctiques de laboratori i anàlisi de dades. Els alumnes realitzen el treball experimental sota la supervisió del professor/s responsable/s de cada sessió.
Els protocols de pràctiques i, si és el cas, els qüestionaris de resposta, estaran disponibles en el Campus Virtual de l’assignatura.
Abans de començar unasessió de pràctiquesl’alumne ha d’haver llegit el protocol i conèixer per tant, els objectius de la pràctica, els fonaments i els procediments que ha de realitzar. Si és el cas, ha de conèixer també les mesures de seguretat específiques i de tractament de residus. En el mòdul de microbiologia, per assistir-hi cal que l’estudiant justifiqui haver superat els tests de seguretat i bioseguretat que trobarà enel Campus Virtual. A més, haurà de complir la normativa de treball en un laboratori de Microbiologia que trobarà indicada en el corresponent protocol.
A les sessions de pràctiques cal portar:
- Protocol i, si és el cas, el qüestionari.
- Una llibreta per a recollir la informació del treball experimental.
- Bata de laboratori.
- Ulleres de protecció.
- Retolador permanent.
- Mascareta
Activitats formatives
| Títol | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|
| Tipus: Dirigides | |||
| Biologia i Genètica Molecular | 12 | 0,48 | 1, 2, 3, 5, 7, 9, 12, 13, 14, 15, 19, 20 |
| Fenòmens de transport | 15 | 0,6 | 1, 2, 4, 5, 7, 9, 11, 12, 14 |
| Microbiologia | 12 | 0,48 | 1, 2, 3, 4, 5, 7, 9, 12, 16, 18, 19, 20 |
| Probabilitat i estadística | 13 | 0,52 | 4, 9, 11 |
| Tipus: Autònomes | |||
| Estudi | 8 | 0,32 | 1, 4, 7, 8, 9, 12, 14 |
| Redacció d'informes i resolució de qüestionaris | 15 | 0,6 | 1, 4, 7, 8, 9, 10, 12, 14 |
Avaluació
Aspectes importants a tenir en compte
- L'assistència a les sessions pràctiques (o sortides de camp) és obligatòria. L'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan l'absència sigui superior al 20% de les sessions programades
- Per participar a la recuperació, l'alumnat ha d'haver estar prèviament avaluat en un conjunt d'activitats el pes de les quals equivalgui a un mínim de dues terceres parts de la qualificació total de l'assignatura o mòdul. Per tant, l'alumnat obtindrà la qualificació de "No Avaluable" quan les activitats d'avaluació realitzades tinguin una ponderació inferior al 67% en la qualificació final.
Sistema d'avaluació dels diferents blocs de l'assignatura
Probabilitat i Estadística
El sistema d’avaluació consta d'un sol component:
1 Avaluació continuada del treball: Resolució dels qüestionaris omplerts pels alumnes al final de cada sessió de pràctiques.
Fenòmens de Transport
El sistema d’avaluació s'organitza en dues parts, cadascuna de les quals tindrà assignat un pes específic en la qualificació final:
1 Avaluació continuada del treball en grup: s’avaluarà l’habilitat pràctica de cada grup d’alumnes diàriament (autoavaluació, anàlisi d’elements consistents i inconsistents, tractament de dades durant les sessions de pràctiques). Competències: E8, T1, T2, T5,T9, T11, T12
2 Avaluació del treball reflectit en un informe escrit sobre els resultats pràctics de cada laboratori (practiques de difussivitat i viscositat/densitat), el qual es lliurarà al professorat al finalitzar de les pràctiques. Competències: E8, T1, T2, T5, T9, T11, T12.
Aquestes proves tindran els següets pesos: Treball al laboratori i actitud 2 punts; Informe escrit : Viscositat i densitat 4 punts, difusivitat 4 punts , respectivament sobre un total de 10.
Microbiologia
El sistema d’avaluació s’organitza en dues parts:
1 Avaluació continuada del treball en grup: s’avaluarà l’habilitat pràctica de cada grup d’alumnes diàriament, la qual consistirà en el lliurament de diferents resultats pràctics al professorat obtingutsen cada sessió de laboratori. Competències: E3, E16,T1, T2, T5, T11, T12.
2 Avaluació individual dels continguts (mòdul de prova escrita): es realitzarà una prova escrita (veure horaris) que consistirà en 20 preguntes test sobre el treball realitzat al laboratori. Competències: E3, T1, T2, T5, T11, T12
Aquestes proves tindran un pes de 4 i 6 punts, sobre 10, respectivament.
Biologia i Genètica Molecular
Aquest mòdul s'avaluarà mitjançant un examen individual en el que s'hauran de resoldre qüestions i exercicis relacionats amb les pràctiques realitzades. L'examen tindrà lloc un cop finalitzades les sessions de pràctiques dels quatre grups (consulteu el calendari).
La supervisiódel treball i dels resultats assolits al laboratori, que es farà durant la realització de les pràctiques (avaluació continuada), proporcionarà fins el 10% de la nota del mòdul.
Avaluació Final
L’avaluació final de l’assignatura s’obtindrà de la mitja ponderada de l’avaluació dels quatre mòduls de què consta l’assignatura.
Per a superar l’assignatura cal assistir a coma mínim el 80% de les sessions programades, obtenir una qualificació final igual o superior a 5 i obtenir un mínim de qualificació de 4 en cada grup de continguts. Els estudiants que no assoleixin la qualificació mínima de 4 en un o més dels grups de continguts rebran una qualificació final màxima de l'assignatura de 4 punts.
Altres aspectes:
- Un estudiant obtindrà la qualificació de No avaluable quan hagi assistit a menys del 50% de les sessions programades d'algun mòdul.
- Els alumnes repetidors tant sols hauran de realitzar i ser avaluats dels continguts dels mòduls que no haguessin estat superats en la primera matrícula (<4). Per als continguts dels mòduls superats es guardarà la nota, durant un període màxim de tres matrícules addicionals de l'assignatura.
- Plagi: Sense perjudici d'altres mesures disciplinàries que s'estimin oportunes, i d'acord amb la normativa acadèmica vigent, es qualificaran amb un zero les irregularitats comeses per l'estudiant que puguin conduir a una variació de la qualificació d'un acte d'avaluació. Per tant, copiar o deixar copiar un test, un exercici o una pràctica o qualsevol altra activitat d'avaluació implicarà suspendre-la amb unzero, i si és necessari superar-la per aprovar, tota l'assignatura quedarà suspesa. No seran recuperables les activitats d'avaluació qualificades d'aquesta forma i per aquest procediment, i per tant l'assignatura serà suspesa directament sense oportunitat de recuperar-la en el mateix curs acadèmic.
Activitats d'avaluació
| Títol | Pes | Hores | ECTS | Resultats d'aprenentatge |
|---|---|---|---|---|
| Biologia i Genètica Molecular: Avaluació continuada | 2,5% | 0 | 0 | 1, 2, 3, 5, 6, 15, 17, 20 |
| Biologia i Genètica Molecular: Examen | 22,5% | 0 | 0 | 1, 7, 9, 12, 13 |
| Fenòmens de transport: Avaluació continuada | 5 % | 0 | 0 | 1, 4, 7, 9, 10, 11, 12, 13, 14 |
| Fenòmens de transport: Informe escrit en grup | 20 % | 0 | 0 | 1, 4, 7, 9, 11, 12, 14 |
| Microbiologia: Avaluació continuada | 10 % | 0 | 0 | 1, 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 15, 16, 18, 19, 20 |
| Microbiologia: Prova escrita individual | 15 % | 0 | 0 | 1, 3, 4, 7, 9, 12, 18, 19, 20 |
| Probabilitat i Estadística: Avaluació continuada | 25% | 0 | 0 | 9 |
Bibliografia
La bibliografia i els enllaços web s’indiquen en els protocols de pràctiques o, si és el cas, en la Guia Docent de la corresponent assignatura de teoria.